Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK8

FAM46D, Putative nucleotidyltransferase FAM46D, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46DQ8NEK8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FAM46DQ8NEK8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM46DQ8NEK8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM46DQ8NEK8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM46DQ8NEK8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM46DQ8NEK8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM46DQ8NEK8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM46DQ8NEK8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM46DQ8NEK8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM46DQ8NEK8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM46DQ8NEK8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM46DQ8NEK8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM46DQ8NEK8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM46DQ8NEK8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM46DQ8NEK8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM46DQ8NEK8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM46DQ8NEK8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM46DQ8NEK8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM46DQ8NEK8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM46DQ8NEK8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM46DQ8NEK8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM46DQ8NEK8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM46DQ8NEK8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM46DQ8NEK8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM46DQ8NEK8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM46DQ8NEK8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM46DQ8NEK8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM46DQ8NEK8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM46DQ8NEK8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM46DQ8NEK8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM46DQ8NEK8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM46DQ8NEK8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM46DQ8NEK8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM46DQ8NEK8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM46DQ8NEK8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM46DQ8NEK8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM46DQ8NEK8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms