Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZFHX3Q15911 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZFHX3Q15911 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ZFHX3Q15911 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZFHX3Q15911 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZFHX3Q15911 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZFHX3Q15911 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZFHX3Q15911 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZFHX3Q15911 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZFHX3Q15911 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZFHX3Q15911 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZFHX3Q15911 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZFHX3Q15911 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZFHX3Q15911 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZFHX3Q15911 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZFHX3Q15911 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZFHX3Q15911 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZFHX3Q15911 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZFHX3Q15911 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZFHX3Q15911 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZFHX3Q15911 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZFHX3Q15911 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZFHX3Q15911 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZFHX3Q15911 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZFHX3Q15911 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZFHX3Q15911 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ZFHX3Q15911 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZFHX3Q15911 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZFHX3Q15911 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZFHX3Q15911 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZFHX3Q15911 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZFHX3Q15911 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZFHX3Q15911 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZFHX3Q15911 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ZFHX3Q15911 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZFHX3Q15911 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZFHX3Q15911 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZFHX3Q15911 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZFHX3Q15911 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZFHX3Q15911 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZFHX3Q15911 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ZFHX3Q15911 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZFHX3Q15911 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZFHX3Q15911 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZFHX3Q15911 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZFHX3Q15911 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ZFHX3Q15911 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZFHX3Q15911 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZFHX3Q15911 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZFHX3Q15911 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZFHX3Q15911 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZFHX3Q15911 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ZFHX3Q15911 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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