Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZD1

C6orf141, Uncharacterized protein C6orf141, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf141Q5SZD1 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C6orf141Q5SZD1 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms