RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337428.7

LRRC71-201, Transcript of leucine rich repeat containing 71, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC71, Length 1,959 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC71-201ENST00000337428 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.79■■■■□ 3.96
LRRC71-201ENST00000337428 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.95■■■■□ 3.19
LRRC71-201ENST00000337428 ABCC9O60706 1549 aa33.38■■■□□ 2.93
LRRC71-201ENST00000337428 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.36■■■□□ 2.93
LRRC71-201ENST00000337428 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.91■■■□□ 2.86
LRRC71-201ENST00000337428 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.9■■■□□ 2.86
LRRC71-201ENST00000337428 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.68■■■□□ 2.82
LRRC71-201ENST00000337428 NACADO15069 1562 aa32.61■■■□□ 2.81
LRRC71-201ENST00000337428 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.44■■■□□ 2.78
LRRC71-201ENST00000337428 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.12■■■□□ 2.73
LRRC71-201ENST00000337428 SCRIBQ14160 1630 aa32.06■■■□□ 2.72
LRRC71-201ENST00000337428 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.85■■■□□ 2.69
LRRC71-201ENST00000337428 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.5■■■□□ 2.63
LRRC71-201ENST00000337428 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.35■■■□□ 2.61
LRRC71-201ENST00000337428 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.95■■■□□ 2.55
LRRC71-201ENST00000337428 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
LRRC71-201ENST00000337428 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.73■■■□□ 2.51
LRRC71-201ENST00000337428 SMARCA4P51532 1647 aa30.71■■■□□ 2.51
LRRC71-201ENST00000337428 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.69■■■□□ 2.5
LRRC71-201ENST00000337428 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
LRRC71-201ENST00000337428 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
LRRC71-201ENST00000337428 WIZO95785 1651 aa30.48■■■□□ 2.47
LRRC71-201ENST00000337428 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.36■■■□□ 2.45
LRRC71-201ENST00000337428 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.28■■■□□ 2.44
LRRC71-201ENST00000337428 SMARCA2P51531 1590 aa30.26■■■□□ 2.43
LRRC71-201ENST00000337428 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.23■■■□□ 2.43
LRRC71-201ENST00000337428 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
LRRC71-201ENST00000337428 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
LRRC71-201ENST00000337428 NCAPD3P42695 1498 aa30.08■■■□□ 2.41
LRRC71-201ENST00000337428 HMGXB3Q12766 1538 aa30.04■■■□□ 2.4
LRRC71-201ENST00000337428 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.81■■■□□ 2.36
LRRC71-201ENST00000337428 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.8■■■□□ 2.36
LRRC71-201ENST00000337428 CFTRP13569 1480 aa29.31■■■□□ 2.28
LRRC71-201ENST00000337428 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.26■■■□□ 2.27
LRRC71-201ENST00000337428 PRDM2Q13029 1718 aa29.21■■■□□ 2.27
LRRC71-201ENST00000337428 NESP48681 1621 aa29.19■■■□□ 2.26
LRRC71-201ENST00000337428 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.16■■■□□ 2.26
LRRC71-201ENST00000337428 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.12■■■□□ 2.25
LRRC71-201ENST00000337428 ABCC8Q09428 1581 aa29.07■■■□□ 2.24
LRRC71-201ENST00000337428 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.97■■■□□ 2.23
LRRC71-201ENST00000337428 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.9■■■□□ 2.22
LRRC71-201ENST00000337428 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.89■■■□□ 2.22
LRRC71-201ENST00000337428 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.88■■■□□ 2.21
LRRC71-201ENST00000337428 SYNJ1O43426 1573 aa28.85■■■□□ 2.21
LRRC71-201ENST00000337428 TRIM41Q8WV44 630 aa28.84■■■□□ 2.21
LRRC71-201ENST00000337428 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.83■■■□□ 2.21
LRRC71-201ENST00000337428 CUX1P39880 1505 aa28.77■■■□□ 2.2
LRRC71-201ENST00000337428 TOP2BQ02880 1626 aa28.75■■■□□ 2.19
LRRC71-201ENST00000337428 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.75■■■□□ 2.19
LRRC71-201ENST00000337428 ERCC6Q03468 1493 aa28.66■■■□□ 2.18
LRRC71-201ENST00000337428 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
LRRC71-201ENST00000337428 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.65■■■□□ 2.18
LRRC71-201ENST00000337428 TOPBP1Q92547 1522 aa28.62■■■□□ 2.17
LRRC71-201ENST00000337428 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.58■■■□□ 2.17
LRRC71-201ENST00000337428 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
LRRC71-201ENST00000337428 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.52■■■□□ 2.16
LRRC71-201ENST00000337428 WDR62O43379 1518 aa28.48■■■□□ 2.15
LRRC71-201ENST00000337428 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.15
LRRC71-201ENST00000337428 SOGA1O94964 1423 aa28.4■■■□□ 2.14
LRRC71-201ENST00000337428 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.34■■■□□ 2.13
LRRC71-201ENST00000337428 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.33■■■□□ 2.13
LRRC71-201ENST00000337428 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
LRRC71-201ENST00000337428 CUX2O14529 1486 aa28.28■■■□□ 2.12
LRRC71-201ENST00000337428 WDR97A6NE52 1622 aa28.27■■■□□ 2.12
LRRC71-201ENST00000337428 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
LRRC71-201ENST00000337428 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.25■■■□□ 2.11
LRRC71-201ENST00000337428 EEA1Q15075 1411 aa28.22■■■□□ 2.11
LRRC71-201ENST00000337428 KIF27Q86VH2 1401 aa28.19■■■□□ 2.1
LRRC71-201ENST00000337428 IFT140Q96RY7 1462 aa28.15■■■□□ 2.1
LRRC71-201ENST00000337428 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.1■■■□□ 2.09
LRRC71-201ENST00000337428 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.08■■■□□ 2.09
LRRC71-201ENST00000337428 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.08
LRRC71-201ENST00000337428 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
LRRC71-201ENST00000337428 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.01■■■□□ 2.07
LRRC71-201ENST00000337428 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.98■■■□□ 2.07
LRRC71-201ENST00000337428 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.98■■■□□ 2.07
LRRC71-201ENST00000337428 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
LRRC71-201ENST00000337428 IGF1RP08069 1367 aa27.97■■■□□ 2.07
LRRC71-201ENST00000337428 PBRM1Q86U86 1689 aa27.95■■■□□ 2.07
LRRC71-201ENST00000337428 KIF21BO75037 1637 aa27.94■■■□□ 2.06
LRRC71-201ENST00000337428 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.93■■■□□ 2.06
LRRC71-201ENST00000337428 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.92■■■□□ 2.06
LRRC71-201ENST00000337428 PRXQ9BXM0 1461 aa27.91■■■□□ 2.06
LRRC71-201ENST00000337428 CUL7Q14999 1698 aa27.86■■■□□ 2.05
LRRC71-201ENST00000337428 GRIN2BQ13224 1484 aa27.85■■■□□ 2.05
LRRC71-201ENST00000337428 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.85■■■□□ 2.05
LRRC71-201ENST00000337428 GOLGA3Q08378 1498 aa27.84■■■□□ 2.05
LRRC71-201ENST00000337428 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.82■■■□□ 2.04
LRRC71-201ENST00000337428 ADAMTS12P58397 1594 aa27.76■■■□□ 2.03
LRRC71-201ENST00000337428 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.74■■■□□ 2.03
LRRC71-201ENST00000337428 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.69■■■□□ 2.02
LRRC71-201ENST00000337428 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
LRRC71-201ENST00000337428 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
LRRC71-201ENST00000337428 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.64■■■□□ 2.01
LRRC71-201ENST00000337428 SYNJ2O15056 1496 aa27.57■■■□□ 2
LRRC71-201ENST00000337428 GRIN2AQ12879 1464 aa27.53■■■□□ 2
LRRC71-201ENST00000337428 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.52■■■□□ 2
LRRC71-201ENST00000337428 CEP162Q5TB80 1403 aa27.49■■□□□ 1.99
LRRC71-201ENST00000337428 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
LRRC71-201ENST00000337428 CHD1O14646 1710 aa27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.2 ms