Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPIBQ01892 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms