RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328268.8

CRELD2-201, Transcript of cysteine rich with EGF like domains 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRELD2, Length 1,357 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD2-201ENST00000328268 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.84■■■■■ 4.93
CRELD2-201ENST00000328268 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.06■■■■■ 4.16
CRELD2-201ENST00000328268 ABCC9O60706 1549 aa40.72■■■■■ 4.11
CRELD2-201ENST00000328268 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.89■■■■□ 3.82
CRELD2-201ENST00000328268 NACADO15069 1562 aa38.68■■■■□ 3.78
CRELD2-201ENST00000328268 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.52■■■■□ 3.76
CRELD2-201ENST00000328268 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.22■■■■□ 3.71
CRELD2-201ENST00000328268 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.15■■■■□ 3.7
CRELD2-201ENST00000328268 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.07■■■■□ 3.69
CRELD2-201ENST00000328268 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.92■■■■□ 3.66
CRELD2-201ENST00000328268 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.86■■■■□ 3.65
CRELD2-201ENST00000328268 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.86■■■■□ 3.65
CRELD2-201ENST00000328268 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.77■■■■□ 3.64
CRELD2-201ENST00000328268 SCRIBQ14160 1630 aa37.45■■■■□ 3.59
CRELD2-201ENST00000328268 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.22■■■■□ 3.55
CRELD2-201ENST00000328268 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.82■■■■□ 3.49
CRELD2-201ENST00000328268 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.8■■■■□ 3.48
CRELD2-201ENST00000328268 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.62■■■■□ 3.45
CRELD2-201ENST00000328268 SMARCA4P51532 1647 aa35.74■■■■□ 3.31
CRELD2-201ENST00000328268 NCAPD3P42695 1498 aa35.67■■■■□ 3.3
CRELD2-201ENST00000328268 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.64■■■■□ 3.3
CRELD2-201ENST00000328268 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.29
CRELD2-201ENST00000328268 SMARCA2P51531 1590 aa35.57■■■■□ 3.28
CRELD2-201ENST00000328268 HMGXB3Q12766 1538 aa35.49■■■■□ 3.27
CRELD2-201ENST00000328268 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.36■■■■□ 3.25
CRELD2-201ENST00000328268 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.35■■■■□ 3.25
CRELD2-201ENST00000328268 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.25
CRELD2-201ENST00000328268 ERCC6Q03468 1493 aa35.12■■■■□ 3.21
CRELD2-201ENST00000328268 NESP48681 1621 aa35.08■■■■□ 3.21
CRELD2-201ENST00000328268 WIZO95785 1651 aa34.99■■■■□ 3.19
CRELD2-201ENST00000328268 CUX2O14529 1486 aa34.92■■■■□ 3.18
CRELD2-201ENST00000328268 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.87■■■■□ 3.17
CRELD2-201ENST00000328268 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.71■■■■□ 3.15
CRELD2-201ENST00000328268 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.69■■■■□ 3.14
CRELD2-201ENST00000328268 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.69■■■■□ 3.14
CRELD2-201ENST00000328268 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.61■■■■□ 3.13
CRELD2-201ENST00000328268 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.6■■■■□ 3.13
CRELD2-201ENST00000328268 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.52■■■■□ 3.12
CRELD2-201ENST00000328268 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.49■■■■□ 3.11
CRELD2-201ENST00000328268 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.32■■■■□ 3.08
CRELD2-201ENST00000328268 CFTRP13569 1480 aa34.29■■■■□ 3.08
CRELD2-201ENST00000328268 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.26■■■■□ 3.07
CRELD2-201ENST00000328268 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.25■■■■□ 3.07
CRELD2-201ENST00000328268 WDR62O43379 1518 aa34.24■■■■□ 3.07
CRELD2-201ENST00000328268 PRDM2Q13029 1718 aa34.14■■■■□ 3.06
CRELD2-201ENST00000328268 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.11■■■■□ 3.05
CRELD2-201ENST00000328268 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.96■■■■□ 3.03
CRELD2-201ENST00000328268 TOPBP1Q92547 1522 aa33.65■■■□□ 2.98
CRELD2-201ENST00000328268 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.57■■■□□ 2.96
CRELD2-201ENST00000328268 ABCC8Q09428 1581 aa33.55■■■□□ 2.96
CRELD2-201ENST00000328268 IFT140Q96RY7 1462 aa33.54■■■□□ 2.96
CRELD2-201ENST00000328268 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.49■■■□□ 2.95
CRELD2-201ENST00000328268 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.4■■■□□ 2.94
CRELD2-201ENST00000328268 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.37■■■□□ 2.93
CRELD2-201ENST00000328268 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.36■■■□□ 2.93
CRELD2-201ENST00000328268 OSCARQ8IYS5 282 aa33.34■■■□□ 2.93
CRELD2-201ENST00000328268 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.32■■■□□ 2.92
CRELD2-201ENST00000328268 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.22■■■□□ 2.918e-7■■■■■ 28.7
CRELD2-201ENST00000328268 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.2■■■□□ 2.91
CRELD2-201ENST00000328268 CUX1P39880 1505 aa33.2■■■□□ 2.9
CRELD2-201ENST00000328268 TRIM41Q8WV44 630 aa33.17■■■□□ 2.9
CRELD2-201ENST00000328268 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.17■■■□□ 2.9
CRELD2-201ENST00000328268 SOGA1O94964 1423 aa33.14■■■□□ 2.9
CRELD2-201ENST00000328268 CHD1O14646 1710 aa33.11■■■□□ 2.89
CRELD2-201ENST00000328268 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.04■■■□□ 2.88
CRELD2-201ENST00000328268 WDR97A6NE52 1622 aa33■■■□□ 2.87
CRELD2-201ENST00000328268 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.99■■■□□ 2.87
CRELD2-201ENST00000328268 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.99■■■□□ 2.87
CRELD2-201ENST00000328268 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.99■■■□□ 2.87
CRELD2-201ENST00000328268 FBLN2P98095 1184 aa32.91■■■□□ 2.86
CRELD2-201ENST00000328268 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.9■■■□□ 2.86
CRELD2-201ENST00000328268 ARHGEF11O15085 1522 aa32.88■■■□□ 2.85
CRELD2-201ENST00000328268 PBRM1Q86U86 1689 aa32.84■■■□□ 2.85
CRELD2-201ENST00000328268 GRIN2BQ13224 1484 aa32.83■■■□□ 2.85
CRELD2-201ENST00000328268 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.81■■■□□ 2.84
CRELD2-201ENST00000328268 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.79■■■□□ 2.84
CRELD2-201ENST00000328268 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.78■■■□□ 2.84
CRELD2-201ENST00000328268 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.77■■■□□ 2.84
CRELD2-201ENST00000328268 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.77■■■□□ 2.84
CRELD2-201ENST00000328268 TOP2BQ02880 1626 aa32.76■■■□□ 2.84
CRELD2-201ENST00000328268 SYNJ1O43426 1573 aa32.75■■■□□ 2.83
CRELD2-201ENST00000328268 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.73■■■□□ 2.83
CRELD2-201ENST00000328268 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.7■■■□□ 2.82
CRELD2-201ENST00000328268 SYNJ2O15056 1496 aa32.69■■■□□ 2.82
CRELD2-201ENST00000328268 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.65■■■□□ 2.82
CRELD2-201ENST00000328268 ARAP1Q96P48 1450 aa32.58■■■□□ 2.81
CRELD2-201ENST00000328268 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.57■■■□□ 2.8
CRELD2-201ENST00000328268 ADAMTS12P58397 1594 aa32.5■■■□□ 2.79
CRELD2-201ENST00000328268 GRIN2AQ12879 1464 aa32.42■■■□□ 2.78
CRELD2-201ENST00000328268 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.39■■■□□ 2.78
CRELD2-201ENST00000328268 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.34■■■□□ 2.77
CRELD2-201ENST00000328268 CEP170Q5SW79 1584 aa32.34■■■□□ 2.77
CRELD2-201ENST00000328268 NUP160Q12769 1436 aa32.28■■■□□ 2.76
CRELD2-201ENST00000328268 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.2■■■□□ 2.75
CRELD2-201ENST00000328268 SHROOM2Q13796 1616 aa32.17■■■□□ 2.74
CRELD2-201ENST00000328268 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.1■■■□□ 2.73
CRELD2-201ENST00000328268 KIF27Q86VH2 1401 aa32.07■■■□□ 2.72
CRELD2-201ENST00000328268 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.03■■■□□ 2.72
CRELD2-201ENST00000328268 CUL7Q14999 1698 aa32.03■■■□□ 2.72
CRELD2-201ENST00000328268 IGF1RP08069 1367 aa32■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms