Protein–RNA interactions for Protein: P19022

CDH2, Cadherin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH2P19022 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH2P19022 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH2P19022 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH2P19022 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH2P19022 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDH2P19022 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH2P19022 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH2P19022 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH2P19022 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH2P19022 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH2P19022 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH2P19022 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH2P19022 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH2P19022 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH2P19022 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH2P19022 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH2P19022 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH2P19022 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH2P19022 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH2P19022 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH2P19022 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH2P19022 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH2P19022 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH2P19022 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH2P19022 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH2P19022 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH2P19022 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH2P19022 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH2P19022 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH2P19022 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH2P19022 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH2P19022 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH2P19022 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDH2P19022 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH2P19022 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH2P19022 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH2P19022 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH2P19022 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH2P19022 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH2P19022 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH2P19022 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH2P19022 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH2P19022 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH2P19022 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH2P19022 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH2P19022 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH2P19022 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH2P19022 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH2P19022 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH2P19022 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH2P19022 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH2P19022 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH2P19022 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH2P19022 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH2P19022 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH2P19022 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH2P19022 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH2P19022 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH2P19022 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH2P19022 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH2P19022 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH2P19022 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH2P19022 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH2P19022 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDH2P19022 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH2P19022 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH2P19022 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH2P19022 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH2P19022 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH2P19022 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH2P19022 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH2P19022 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH2P19022 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDH2P19022 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH2P19022 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH2P19022 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH2P19022 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH2P19022 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH2P19022 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH2P19022 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH2P19022 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH2P19022 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH2P19022 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH2P19022 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH2P19022 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH2P19022 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH2P19022 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH2P19022 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH2P19022 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH2P19022 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH2P19022 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH2P19022 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH2P19022 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH2P19022 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH2P19022 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH2P19022 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH2P19022 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH2P19022 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH2P19022 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDH2P19022 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms