RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376808.8

NMRK1-202, Transcript of nicotinamide riboside kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NMRK1, Length 1,121 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMRK1-202ENST00000376808 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.44■■■■■ 4.86
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NMRK1-202ENST00000376808 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.5■■■■□ 3.75
NMRK1-202ENST00000376808 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.39■■■■□ 3.74
NMRK1-202ENST00000376808 NACADO15069 1562 aa38.32■■■■□ 3.73
NMRK1-202ENST00000376808 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.9■■■■□ 3.66
NMRK1-202ENST00000376808 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.9■■■■□ 3.66
NMRK1-202ENST00000376808 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.83■■■■□ 3.65
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NMRK1-202ENST00000376808 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.5■■■■□ 3.59
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NMRK1-202ENST00000376808 SCRIBQ14160 1630 aa36.99■■■■□ 3.51
NMRK1-202ENST00000376808 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.88■■■■□ 3.5
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NMRK1-202ENST00000376808 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.47■■■■□ 3.43
NMRK1-202ENST00000376808 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.41■■■■□ 3.42
NMRK1-202ENST00000376808 NCAPD3P42695 1498 aa35.48■■■■□ 3.27
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NMRK1-202ENST00000376808 SMARCA2P51531 1590 aa35.21■■■■□ 3.23
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NMRK1-202ENST00000376808 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.89■■■■□ 3.18
NMRK1-202ENST00000376808 ERCC6Q03468 1493 aa34.86■■■■□ 3.17
NMRK1-202ENST00000376808 NESP48681 1621 aa34.84■■■■□ 3.17
NMRK1-202ENST00000376808 CUX2O14529 1486 aa34.7■■■■□ 3.15
NMRK1-202ENST00000376808 WIZO95785 1651 aa34.54■■■■□ 3.12
NMRK1-202ENST00000376808 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.52■■■■□ 3.12
NMRK1-202ENST00000376808 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
NMRK1-202ENST00000376808 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.44■■■■□ 3.1
NMRK1-202ENST00000376808 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.4■■■■□ 3.1
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NMRK1-202ENST00000376808 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
NMRK1-202ENST00000376808 CFTRP13569 1480 aa34.06■■■■□ 3.04
NMRK1-202ENST00000376808 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.06■■■■□ 3.04
NMRK1-202ENST00000376808 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.99■■■■□ 3.03
NMRK1-202ENST00000376808 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.95■■■■□ 3.03
NMRK1-202ENST00000376808 WDR62O43379 1518 aa33.94■■■■□ 3.02
NMRK1-202ENST00000376808 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.85■■■■□ 3.01
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NMRK1-202ENST00000376808 TOPBP1Q92547 1522 aa33.36■■■□□ 2.93
NMRK1-202ENST00000376808 IFT140Q96RY7 1462 aa33.31■■■□□ 2.92
NMRK1-202ENST00000376808 OSCARQ8IYS5 282 aa33.29■■■□□ 2.92
NMRK1-202ENST00000376808 ABCC8Q09428 1581 aa33.28■■■□□ 2.92
NMRK1-202ENST00000376808 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.28■■■□□ 2.92
NMRK1-202ENST00000376808 TRIM41Q8WV44 630 aa33.2■■■□□ 2.91
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NMRK1-202ENST00000376808 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.86■■■□□ 2.85
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NMRK1-202ENST00000376808 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.66■■■□□ 2.82
NMRK1-202ENST00000376808 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.66■■■□□ 2.82
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NMRK1-202ENST00000376808 ARHGEF11O15085 1522 aa32.64■■■□□ 2.82
NMRK1-202ENST00000376808 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.63■■■□□ 2.81
NMRK1-202ENST00000376808 WDR97A6NE52 1622 aa32.6■■■□□ 2.81
NMRK1-202ENST00000376808 CHD1O14646 1710 aa32.6■■■□□ 2.81
NMRK1-202ENST00000376808 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.58■■■□□ 2.81
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NMRK1-202ENST00000376808 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.36■■■□□ 2.77
NMRK1-202ENST00000376808 TOP2BQ02880 1626 aa32.35■■■□□ 2.77
NMRK1-202ENST00000376808 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.35■■■□□ 2.77
NMRK1-202ENST00000376808 SYNJ1O43426 1573 aa32.35■■■□□ 2.77
NMRK1-202ENST00000376808 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.3■■■□□ 2.76
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NMRK1-202ENST00000376808 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.05■■■□□ 2.72
NMRK1-202ENST00000376808 CEP170Q5SW79 1584 aa32■■■□□ 2.71
NMRK1-202ENST00000376808 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.92■■■□□ 2.7
NMRK1-202ENST00000376808 IGF1RP08069 1367 aa31.87■■■□□ 2.69
NMRK1-202ENST00000376808 JPH4Q96JJ6 628 aa31.84■■■□□ 2.69
NMRK1-202ENST00000376808 KIF27Q86VH2 1401 aa31.82■■■□□ 2.68
NMRK1-202ENST00000376808 SHROOM2Q13796 1616 aa31.78■■■□□ 2.68
NMRK1-202ENST00000376808 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.76■■■□□ 2.68
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