RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376808.8

NMRK1-202, Transcript of nicotinamide riboside kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NMRK1, Length 1,121 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMRK1-202ENST00000376808 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.44■■■■■ 4.86
NMRK1-202ENST00000376808 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.47■■■■■ 4.07
NMRK1-202ENST00000376808 ABCC9O60706 1549 aa40.46■■■■■ 4.07
NMRK1-202ENST00000376808 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.5■■■■□ 3.75
NMRK1-202ENST00000376808 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.39■■■■□ 3.74
NMRK1-202ENST00000376808 NACADO15069 1562 aa38.32■■■■□ 3.73
NMRK1-202ENST00000376808 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.9■■■■□ 3.66
NMRK1-202ENST00000376808 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.9■■■■□ 3.66
NMRK1-202ENST00000376808 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.83■■■■□ 3.65
NMRK1-202ENST00000376808 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.68■■■■□ 3.62
NMRK1-202ENST00000376808 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.51■■■■□ 3.59
NMRK1-202ENST00000376808 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.5■■■■□ 3.59
NMRK1-202ENST00000376808 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.43■■■■□ 3.58
NMRK1-202ENST00000376808 SCRIBQ14160 1630 aa36.99■■■■□ 3.51
NMRK1-202ENST00000376808 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.88■■■■□ 3.5
NMRK1-202ENST00000376808 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.47■■■■□ 3.43
NMRK1-202ENST00000376808 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.47■■■■□ 3.43
NMRK1-202ENST00000376808 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.41■■■■□ 3.42
NMRK1-202ENST00000376808 NCAPD3P42695 1498 aa35.48■■■■□ 3.27
NMRK1-202ENST00000376808 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.4■■■■□ 3.26
NMRK1-202ENST00000376808 SMARCA4P51532 1647 aa35.31■■■■□ 3.24
NMRK1-202ENST00000376808 SMARCA2P51531 1590 aa35.21■■■■□ 3.23
NMRK1-202ENST00000376808 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.19■■■■□ 3.22
NMRK1-202ENST00000376808 HMGXB3Q12766 1538 aa35.11■■■■□ 3.21
NMRK1-202ENST00000376808 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.04■■■■□ 3.2
NMRK1-202ENST00000376808 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.01■■■■□ 3.19
NMRK1-202ENST00000376808 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.98■■■■□ 3.19
NMRK1-202ENST00000376808 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.89■■■■□ 3.18
NMRK1-202ENST00000376808 ERCC6Q03468 1493 aa34.86■■■■□ 3.17
NMRK1-202ENST00000376808 NESP48681 1621 aa34.84■■■■□ 3.17
NMRK1-202ENST00000376808 CUX2O14529 1486 aa34.7■■■■□ 3.15
NMRK1-202ENST00000376808 WIZO95785 1651 aa34.54■■■■□ 3.12
NMRK1-202ENST00000376808 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.52■■■■□ 3.12
NMRK1-202ENST00000376808 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
NMRK1-202ENST00000376808 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.44■■■■□ 3.1
NMRK1-202ENST00000376808 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.4■■■■□ 3.1
NMRK1-202ENST00000376808 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.3■■■■□ 3.08
NMRK1-202ENST00000376808 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.21■■■■□ 3.07
NMRK1-202ENST00000376808 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
NMRK1-202ENST00000376808 CFTRP13569 1480 aa34.06■■■■□ 3.04
NMRK1-202ENST00000376808 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.06■■■■□ 3.04
NMRK1-202ENST00000376808 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.99■■■■□ 3.03
NMRK1-202ENST00000376808 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.95■■■■□ 3.03
NMRK1-202ENST00000376808 WDR62O43379 1518 aa33.94■■■■□ 3.02
NMRK1-202ENST00000376808 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.85■■■■□ 3.01
NMRK1-202ENST00000376808 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.7■■■□□ 2.99
NMRK1-202ENST00000376808 PRDM2Q13029 1718 aa33.42■■■□□ 2.94
NMRK1-202ENST00000376808 TOPBP1Q92547 1522 aa33.36■■■□□ 2.93
NMRK1-202ENST00000376808 IFT140Q96RY7 1462 aa33.31■■■□□ 2.92
NMRK1-202ENST00000376808 OSCARQ8IYS5 282 aa33.29■■■□□ 2.92
NMRK1-202ENST00000376808 ABCC8Q09428 1581 aa33.28■■■□□ 2.92
NMRK1-202ENST00000376808 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.28■■■□□ 2.92
NMRK1-202ENST00000376808 TRIM41Q8WV44 630 aa33.2■■■□□ 2.91
NMRK1-202ENST00000376808 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.2■■■□□ 2.91
NMRK1-202ENST00000376808 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.17■■■□□ 2.9
NMRK1-202ENST00000376808 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.05■■■□□ 2.88
NMRK1-202ENST00000376808 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.03■■■□□ 2.88
NMRK1-202ENST00000376808 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.99■■■□□ 2.87
NMRK1-202ENST00000376808 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.97■■■□□ 2.87
NMRK1-202ENST00000376808 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.96■■■□□ 2.87
NMRK1-202ENST00000376808 SOGA1O94964 1423 aa32.95■■■□□ 2.87
NMRK1-202ENST00000376808 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.89■■■□□ 2.86
NMRK1-202ENST00000376808 CUX1P39880 1505 aa32.88■■■□□ 2.85
NMRK1-202ENST00000376808 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.86■■■□□ 2.85
NMRK1-202ENST00000376808 FBLN2P98095 1184 aa32.79■■■□□ 2.84
NMRK1-202ENST00000376808 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.66■■■□□ 2.82
NMRK1-202ENST00000376808 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.66■■■□□ 2.82
NMRK1-202ENST00000376808 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.66■■■□□ 2.82
NMRK1-202ENST00000376808 ARHGEF11O15085 1522 aa32.64■■■□□ 2.82
NMRK1-202ENST00000376808 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.63■■■□□ 2.81
NMRK1-202ENST00000376808 WDR97A6NE52 1622 aa32.6■■■□□ 2.81
NMRK1-202ENST00000376808 CHD1O14646 1710 aa32.6■■■□□ 2.81
NMRK1-202ENST00000376808 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.58■■■□□ 2.81
NMRK1-202ENST00000376808 GRIN2BQ13224 1484 aa32.58■■■□□ 2.81
NMRK1-202ENST00000376808 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.53■■■□□ 2.8
NMRK1-202ENST00000376808 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.52■■■□□ 2.8
NMRK1-202ENST00000376808 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.51■■■□□ 2.79
NMRK1-202ENST00000376808 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.51■■■□□ 2.79
NMRK1-202ENST00000376808 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.45■■■□□ 2.79
NMRK1-202ENST00000376808 SYNJ2O15056 1496 aa32.43■■■□□ 2.78
NMRK1-202ENST00000376808 ARAP1Q96P48 1450 aa32.36■■■□□ 2.77
NMRK1-202ENST00000376808 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.36■■■□□ 2.77
NMRK1-202ENST00000376808 TOP2BQ02880 1626 aa32.35■■■□□ 2.77
NMRK1-202ENST00000376808 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.35■■■□□ 2.77
NMRK1-202ENST00000376808 SYNJ1O43426 1573 aa32.35■■■□□ 2.77
NMRK1-202ENST00000376808 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.3■■■□□ 2.76
NMRK1-202ENST00000376808 PBRM1Q86U86 1689 aa32.28■■■□□ 2.76
NMRK1-202ENST00000376808 GRIN2AQ12879 1464 aa32.15■■■□□ 2.74
NMRK1-202ENST00000376808 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.12■■■□□ 2.73
NMRK1-202ENST00000376808 ADAMTS12P58397 1594 aa32.1■■■□□ 2.73
NMRK1-202ENST00000376808 NUP160Q12769 1436 aa32.07■■■□□ 2.72
NMRK1-202ENST00000376808 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.06■■■□□ 2.72
NMRK1-202ENST00000376808 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.05■■■□□ 2.72
NMRK1-202ENST00000376808 CEP170Q5SW79 1584 aa32■■■□□ 2.71
NMRK1-202ENST00000376808 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.92■■■□□ 2.7
NMRK1-202ENST00000376808 IGF1RP08069 1367 aa31.87■■■□□ 2.69
NMRK1-202ENST00000376808 JPH4Q96JJ6 628 aa31.84■■■□□ 2.69
NMRK1-202ENST00000376808 KIF27Q86VH2 1401 aa31.82■■■□□ 2.68
NMRK1-202ENST00000376808 SHROOM2Q13796 1616 aa31.78■■■□□ 2.68
NMRK1-202ENST00000376808 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.76■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms