RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480559.5

GGTLC2-203, Transcript of gamma-glutamyltransferase light chain 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GGTLC2, Length 657 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC2-203ENST00000480559 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.4■■■■■ 4.7
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GGTLC2-203ENST00000480559 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.44■■■■□ 3.58
GGTLC2-203ENST00000480559 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.38■■■■□ 3.58
GGTLC2-203ENST00000480559 NACADO15069 1562 aa37.25■■■■□ 3.55
GGTLC2-203ENST00000480559 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.93■■■■□ 3.5
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GGTLC2-203ENST00000480559 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.63■■■■□ 3.45
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GGTLC2-203ENST00000480559 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.53■■■■□ 3.44
GGTLC2-203ENST00000480559 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.25■■■■□ 3.39
GGTLC2-203ENST00000480559 SCRIBQ14160 1630 aa36.2■■■■□ 3.39
GGTLC2-203ENST00000480559 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.08■■■■□ 3.37
GGTLC2-203ENST00000480559 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.74■■■■□ 3.31
GGTLC2-203ENST00000480559 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
GGTLC2-203ENST00000480559 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.28■■■■□ 3.24
GGTLC2-203ENST00000480559 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.1■■■■□ 3.21
GGTLC2-203ENST00000480559 SMARCA4P51532 1647 aa34.52■■■■□ 3.12
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GGTLC2-203ENST00000480559 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.39■■■■□ 3.1
GGTLC2-203ENST00000480559 NCAPD3P42695 1498 aa34.37■■■■□ 3.09
GGTLC2-203ENST00000480559 SMARCA2P51531 1590 aa34.32■■■■□ 3.09
GGTLC2-203ENST00000480559 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.27■■■■□ 3.08
GGTLC2-203ENST00000480559 HMGXB3Q12766 1538 aa34.17■■■■□ 3.06
GGTLC2-203ENST00000480559 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
GGTLC2-203ENST00000480559 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.11■■■■□ 3.05
GGTLC2-203ENST00000480559 WIZO95785 1651 aa33.9■■■■□ 3.02
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GGTLC2-203ENST00000480559 ERCC6Q03468 1493 aa33.71■■■□□ 2.99
GGTLC2-203ENST00000480559 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.51■■■□□ 2.96
GGTLC2-203ENST00000480559 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.48■■■□□ 2.95
GGTLC2-203ENST00000480559 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.4■■■□□ 2.94
GGTLC2-203ENST00000480559 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.34■■■□□ 2.93
GGTLC2-203ENST00000480559 CUX2O14529 1486 aa33.33■■■□□ 2.93
GGTLC2-203ENST00000480559 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.29■■■□□ 2.92
GGTLC2-203ENST00000480559 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.2■■■□□ 2.91
GGTLC2-203ENST00000480559 CFTRP13569 1480 aa33.12■■■□□ 2.89
GGTLC2-203ENST00000480559 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.12■■■□□ 2.89
GGTLC2-203ENST00000480559 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.05■■■□□ 2.88
GGTLC2-203ENST00000480559 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.03■■■□□ 2.88
GGTLC2-203ENST00000480559 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.02■■■□□ 2.88
GGTLC2-203ENST00000480559 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.91■■■□□ 2.86
GGTLC2-203ENST00000480559 WDR62O43379 1518 aa32.88■■■□□ 2.85
GGTLC2-203ENST00000480559 PRDM2Q13029 1718 aa32.82■■■□□ 2.85
GGTLC2-203ENST00000480559 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.72■■■□□ 2.83
GGTLC2-203ENST00000480559 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.64■■■□□ 2.82
GGTLC2-203ENST00000480559 TOPBP1Q92547 1522 aa32.48■■■□□ 2.79
GGTLC2-203ENST00000480559 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.41■■■□□ 2.78
GGTLC2-203ENST00000480559 ABCC8Q09428 1581 aa32.4■■■□□ 2.78
GGTLC2-203ENST00000480559 IFT140Q96RY7 1462 aa32.32■■■□□ 2.76
GGTLC2-203ENST00000480559 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.25■■■□□ 2.75
GGTLC2-203ENST00000480559 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
GGTLC2-203ENST00000480559 CUX1P39880 1505 aa32.15■■■□□ 2.74
GGTLC2-203ENST00000480559 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.11■■■□□ 2.73
GGTLC2-203ENST00000480559 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.11■■■□□ 2.73
GGTLC2-203ENST00000480559 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.1■■■□□ 2.73
GGTLC2-203ENST00000480559 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.09■■■□□ 2.73
GGTLC2-203ENST00000480559 SOGA1O94964 1423 aa32.09■■■□□ 2.73
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GGTLC2-203ENST00000480559 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
GGTLC2-203ENST00000480559 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.87■■■□□ 2.69
GGTLC2-203ENST00000480559 FBLN2P98095 1184 aa31.82■■■□□ 2.68
GGTLC2-203ENST00000480559 SYNJ1O43426 1573 aa31.81■■■□□ 2.68
GGTLC2-203ENST00000480559 WDR97A6NE52 1622 aa31.78■■■□□ 2.68
GGTLC2-203ENST00000480559 TOP2BQ02880 1626 aa31.78■■■□□ 2.68
GGTLC2-203ENST00000480559 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.76■■■□□ 2.67
GGTLC2-203ENST00000480559 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.74■■■□□ 2.67
GGTLC2-203ENST00000480559 CHD1O14646 1710 aa31.73■■■□□ 2.67
GGTLC2-203ENST00000480559 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.72■■■□□ 2.67
GGTLC2-203ENST00000480559 GRIN2BQ13224 1484 aa31.71■■■□□ 2.67
GGTLC2-203ENST00000480559 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.69■■■□□ 2.66
GGTLC2-203ENST00000480559 TRIM41Q8WV44 630 aa31.63■■■□□ 2.65
GGTLC2-203ENST00000480559 PBRM1Q86U86 1689 aa31.63■■■□□ 2.65
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GGTLC2-203ENST00000480559 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.62■■■□□ 2.65
GGTLC2-203ENST00000480559 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
GGTLC2-203ENST00000480559 SYNJ2O15056 1496 aa31.52■■■□□ 2.64
GGTLC2-203ENST00000480559 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.48■■■□□ 2.63
GGTLC2-203ENST00000480559 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.48■■■□□ 2.63
GGTLC2-203ENST00000480559 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.48■■■□□ 2.63
GGTLC2-203ENST00000480559 ARHGEF11O15085 1522 aa31.44■■■□□ 2.62
GGTLC2-203ENST00000480559 ADAMTS12P58397 1594 aa31.36■■■□□ 2.61
GGTLC2-203ENST00000480559 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.34■■■□□ 2.61
GGTLC2-203ENST00000480559 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.33■■■□□ 2.61
GGTLC2-203ENST00000480559 GRIN2AQ12879 1464 aa31.3■■■□□ 2.6
GGTLC2-203ENST00000480559 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.3■■■□□ 2.6
GGTLC2-203ENST00000480559 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.26■■■□□ 2.59
GGTLC2-203ENST00000480559 KIF27Q86VH2 1401 aa31.22■■■□□ 2.59
GGTLC2-203ENST00000480559 ARAP1Q96P48 1450 aa31.18■■■□□ 2.58
GGTLC2-203ENST00000480559 CEP170Q5SW79 1584 aa31.17■■■□□ 2.58
GGTLC2-203ENST00000480559 NUP160Q12769 1436 aa31.14■■■□□ 2.58
GGTLC2-203ENST00000480559 IGF1RP08069 1367 aa31.1■■■□□ 2.57
GGTLC2-203ENST00000480559 CUL7Q14999 1698 aa31■■■□□ 2.55
GGTLC2-203ENST00000480559 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.97■■■□□ 2.55
GGTLC2-203ENST00000480559 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.95■■■□□ 2.55
GGTLC2-203ENST00000480559 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.92■■■□□ 2.54
GGTLC2-203ENST00000480559 SHROOM2Q13796 1616 aa30.91■■■□□ 2.54
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