RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356455.8

UBE2C-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2C, Length 850 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-204ENST00000356455 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.74■■■■■ 5.07
UBE2C-204ENST00000356455 ABCC9O60706 1549 aa42.84■■■■■ 4.45
UBE2C-204ENST00000356455 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.16■■■■■ 4.34
UBE2C-204ENST00000356455 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.67■■■■■ 4.1
UBE2C-204ENST00000356455 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.48■■■■■ 4.07
UBE2C-204ENST00000356455 NACADO15069 1562 aa40.03■■■■■ 4
UBE2C-204ENST00000356455 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.9■■■■□ 3.98
UBE2C-204ENST00000356455 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.83■■■■□ 3.97
UBE2C-204ENST00000356455 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.49■■■■□ 3.91
UBE2C-204ENST00000356455 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.25■■■■□ 3.87
UBE2C-204ENST00000356455 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.23■■■■□ 3.87
UBE2C-204ENST00000356455 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.66■■■■□ 3.78
UBE2C-204ENST00000356455 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.64■■■■□ 3.78
UBE2C-204ENST00000356455 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.62■■■■□ 3.77
UBE2C-204ENST00000356455 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.6■■■■□ 3.77
UBE2C-204ENST00000356455 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.52■■■■□ 3.76
UBE2C-204ENST00000356455 SCRIBQ14160 1630 aa38.46■■■■□ 3.75
UBE2C-204ENST00000356455 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.39■■■■□ 3.74
UBE2C-204ENST00000356455 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.79■■■■□ 3.64
UBE2C-204ENST00000356455 CUX2O14529 1486 aa37.12■■■■□ 3.53
UBE2C-204ENST00000356455 ERCC6Q03468 1493 aa37.07■■■■□ 3.52
UBE2C-204ENST00000356455 NCAPD3P42695 1498 aa36.95■■■■□ 3.51
UBE2C-204ENST00000356455 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.78■■■■□ 3.48
UBE2C-204ENST00000356455 SMARCA2P51531 1590 aa36.65■■■■□ 3.46
UBE2C-204ENST00000356455 HMGXB3Q12766 1538 aa36.62■■■■□ 3.45
UBE2C-204ENST00000356455 NESP48681 1621 aa36.6■■■■□ 3.45
UBE2C-204ENST00000356455 SMARCA4P51532 1647 aa36.59■■■■□ 3.45
UBE2C-204ENST00000356455 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
UBE2C-204ENST00000356455 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
UBE2C-204ENST00000356455 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
UBE2C-204ENST00000356455 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.23■■■■□ 3.39
UBE2C-204ENST00000356455 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.18■■■■□ 3.38
UBE2C-204ENST00000356455 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.09■■■■□ 3.37
UBE2C-204ENST00000356455 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.08■■■■□ 3.37
UBE2C-204ENST00000356455 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.02■■■■□ 3.36
UBE2C-204ENST00000356455 TRIM41Q8WV44 630 aa36.01■■■■□ 3.36
UBE2C-204ENST00000356455 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.85■■■■□ 3.33
UBE2C-204ENST00000356455 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.8■■■■□ 3.32
UBE2C-204ENST00000356455 WDR62O43379 1518 aa35.68■■■■□ 3.3
UBE2C-204ENST00000356455 WIZO95785 1651 aa35.56■■■■□ 3.28
UBE2C-204ENST00000356455 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.54■■■■□ 3.28
UBE2C-204ENST00000356455 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.45■■■■□ 3.27
UBE2C-204ENST00000356455 OSCARQ8IYS5 282 aa35.39■■■■□ 3.26
UBE2C-204ENST00000356455 CFTRP13569 1480 aa35.29■■■■□ 3.24
UBE2C-204ENST00000356455 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
UBE2C-204ENST00000356455 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
UBE2C-204ENST00000356455 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
UBE2C-204ENST00000356455 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.94■■■■□ 3.18
UBE2C-204ENST00000356455 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.94■■■■□ 3.18
UBE2C-204ENST00000356455 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.94■■■■□ 3.18
UBE2C-204ENST00000356455 IFT140Q96RY7 1462 aa34.85■■■■□ 3.17
UBE2C-204ENST00000356455 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.85■■■■□ 3.17
UBE2C-204ENST00000356455 PRDM2Q13029 1718 aa34.84■■■■□ 3.17
UBE2C-204ENST00000356455 ARHGEF11O15085 1522 aa34.76■■■■□ 3.16
UBE2C-204ENST00000356455 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.7■■■■□ 3.15
UBE2C-204ENST00000356455 TOPBP1Q92547 1522 aa34.7■■■■□ 3.14
UBE2C-204ENST00000356455 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.63■■■■□ 3.13
UBE2C-204ENST00000356455 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.61■■■■□ 3.13
UBE2C-204ENST00000356455 ABCC8Q09428 1581 aa34.58■■■■□ 3.13
UBE2C-204ENST00000356455 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.51■■■■□ 3.12
UBE2C-204ENST00000356455 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.5■■■■□ 3.11
UBE2C-204ENST00000356455 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.48■■■■□ 3.116e-10■■■■■ 45.2
UBE2C-204ENST00000356455 FBLN2P98095 1184 aa34.47■■■■□ 3.11
UBE2C-204ENST00000356455 CHD1O14646 1710 aa34.46■■■■□ 3.11
UBE2C-204ENST00000356455 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.39■■■■□ 3.1
UBE2C-204ENST00000356455 ARAP1Q96P48 1450 aa34.39■■■■□ 3.1
UBE2C-204ENST00000356455 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.3■■■■□ 3.08
UBE2C-204ENST00000356455 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.22■■■■□ 3.07
UBE2C-204ENST00000356455 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.07
UBE2C-204ENST00000356455 SOGA1O94964 1423 aa34.18■■■■□ 3.06
UBE2C-204ENST00000356455 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.11■■■■□ 3.05
UBE2C-204ENST00000356455 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.09■■■■□ 3.05
UBE2C-204ENST00000356455 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.03■■■■□ 3.04
UBE2C-204ENST00000356455 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.02■■■■□ 3.04
UBE2C-204ENST00000356455 SYNJ1O43426 1573 aa34.01■■■■□ 3.03
UBE2C-204ENST00000356455 WDR97A6NE52 1622 aa34■■■■□ 3.03
UBE2C-204ENST00000356455 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.96■■■■□ 3.03
UBE2C-204ENST00000356455 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.94■■■■□ 3.02
UBE2C-204ENST00000356455 GRIN2BQ13224 1484 aa33.93■■■■□ 3.02
UBE2C-204ENST00000356455 CUX1P39880 1505 aa33.88■■■■□ 3.01
UBE2C-204ENST00000356455 SYNJ2O15056 1496 aa33.88■■■■□ 3.01
UBE2C-204ENST00000356455 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.76■■■■□ 3
UBE2C-204ENST00000356455 PBRM1Q86U86 1689 aa33.72■■■□□ 2.99
UBE2C-204ENST00000356455 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.57■■■□□ 2.96
UBE2C-204ENST00000356455 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.55■■■□□ 2.96
UBE2C-204ENST00000356455 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.49■■■□□ 2.95
UBE2C-204ENST00000356455 GRIN2AQ12879 1464 aa33.48■■■□□ 2.95
UBE2C-204ENST00000356455 CEP170Q5SW79 1584 aa33.39■■■□□ 2.94
UBE2C-204ENST00000356455 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.37■■■□□ 2.93
UBE2C-204ENST00000356455 ADAMTS12P58397 1594 aa33.37■■■□□ 2.93
UBE2C-204ENST00000356455 NUP160Q12769 1436 aa33.36■■■□□ 2.93
UBE2C-204ENST00000356455 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.28■■■□□ 2.92
UBE2C-204ENST00000356455 SHROOM2Q13796 1616 aa33.25■■■□□ 2.91
UBE2C-204ENST00000356455 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.21■■■□□ 2.91
UBE2C-204ENST00000356455 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.16■■■□□ 2.9
UBE2C-204ENST00000356455 TOP2BQ02880 1626 aa33.16■■■□□ 2.9
UBE2C-204ENST00000356455 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.15■■■□□ 2.9
UBE2C-204ENST00000356455 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.14■■■□□ 2.9
UBE2C-204ENST00000356455 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.14■■■□□ 2.9
UBE2C-204ENST00000356455 JPH4Q96JJ6 628 aa33.09■■■□□ 2.89
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