Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UBXN8O00124 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms