Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
UBXN8O00124 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
UBXN8O00124 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
UBXN8O00124 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
UBXN8O00124 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
UBXN8O00124 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
UBXN8O00124 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
UBXN8O00124 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
UBXN8O00124 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
UBXN8O00124 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
UBXN8O00124 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
UBXN8O00124 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
UBXN8O00124 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
UBXN8O00124 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
UBXN8O00124 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
UBXN8O00124 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
UBXN8O00124 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
UBXN8O00124 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
UBXN8O00124 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
UBXN8O00124 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
UBXN8O00124 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
UBXN8O00124 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
UBXN8O00124 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
UBXN8O00124 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
UBXN8O00124 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
UBXN8O00124 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
UBXN8O00124 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
UBXN8O00124 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
UBXN8O00124 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
UBXN8O00124 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
UBXN8O00124 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
UBXN8O00124 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
UBXN8O00124 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
UBXN8O00124 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
UBXN8O00124 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
UBXN8O00124 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
UBXN8O00124 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
UBXN8O00124 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
UBXN8O00124 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
UBXN8O00124 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
UBXN8O00124 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
UBXN8O00124 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
UBXN8O00124 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
UBXN8O00124 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
UBXN8O00124 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
UBXN8O00124 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
UBXN8O00124 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
UBXN8O00124 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
UBXN8O00124 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
UBXN8O00124 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
UBXN8O00124 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
UBXN8O00124 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
UBXN8O00124 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
UBXN8O00124 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
UBXN8O00124 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
UBXN8O00124 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
UBXN8O00124 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
UBXN8O00124 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
UBXN8O00124 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBXN8O00124 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBXN8O00124 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBXN8O00124 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBXN8O00124 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
UBXN8O00124 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBXN8O00124 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
UBXN8O00124 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBXN8O00124 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
UBXN8O00124 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBXN8O00124 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBXN8O00124 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBXN8O00124 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBXN8O00124 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBXN8O00124 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UBXN8O00124 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBXN8O00124 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBXN8O00124 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBXN8O00124 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBXN8O00124 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBXN8O00124 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBXN8O00124 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UBXN8O00124 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBXN8O00124 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
UBXN8O00124 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBXN8O00124 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBXN8O00124 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
UBXN8O00124 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBXN8O00124 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
UBXN8O00124 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBXN8O00124 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBXN8O00124 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
UBXN8O00124 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
UBXN8O00124 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBXN8O00124 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
UBXN8O00124 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBXN8O00124 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBXN8O00124 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBXN8O00124 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBXN8O00124 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBXN8O00124 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBXN8O00124 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms