Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VIRMAQ69YN4 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
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