RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.55■■■■□ 3.92
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.73■■■■□ 3.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 ABCC9O60706 1549 aa33.27■■■□□ 2.92
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.11■■■□□ 2.89
TOP3BP1-201ENST00000420768 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.79■■■□□ 2.84
TOP3BP1-201ENST00000420768 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.75■■■□□ 2.83
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.65■■■□□ 2.82
TOP3BP1-201ENST00000420768 NACADO15069 1562 aa32.53■■■□□ 2.8
TOP3BP1-201ENST00000420768 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.36■■■□□ 2.77
TOP3BP1-201ENST00000420768 SCRIBQ14160 1630 aa31.76■■■□□ 2.67
TOP3BP1-201ENST00000420768 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.73■■■□□ 2.67
TOP3BP1-201ENST00000420768 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.44■■■□□ 2.62
TOP3BP1-201ENST00000420768 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.32■■■□□ 2.6
TOP3BP1-201ENST00000420768 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.27■■■□□ 2.6
TOP3BP1-201ENST00000420768 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.7■■■□□ 2.5
TOP3BP1-201ENST00000420768 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.6■■■□□ 2.49
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMARCA4P51532 1647 aa30.47■■■□□ 2.47
TOP3BP1-201ENST00000420768 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.47■■■□□ 2.47
TOP3BP1-201ENST00000420768 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
TOP3BP1-201ENST00000420768 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.47
TOP3BP1-201ENST00000420768 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
TOP3BP1-201ENST00000420768 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.2■■■□□ 2.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.16■■■□□ 2.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMARCA2P51531 1590 aa30.16■■■□□ 2.42
TOP3BP1-201ENST00000420768 WIZO95785 1651 aa30.12■■■□□ 2.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.1■■■□□ 2.41
TOP3BP1-201ENST00000420768 NCAPD3P42695 1498 aa30.06■■■□□ 2.4
TOP3BP1-201ENST00000420768 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
TOP3BP1-201ENST00000420768 HMGXB3Q12766 1538 aa29.94■■■□□ 2.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
TOP3BP1-201ENST00000420768 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.83■■■□□ 2.37
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.58■■■□□ 2.33
TOP3BP1-201ENST00000420768 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.23■■■□□ 2.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 CFTRP13569 1480 aa29.21■■■□□ 2.27
TOP3BP1-201ENST00000420768 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.08■■■□□ 2.25
TOP3BP1-201ENST00000420768 NESP48681 1621 aa29.01■■■□□ 2.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.92■■■□□ 2.22
TOP3BP1-201ENST00000420768 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.86■■■□□ 2.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRDM2Q13029 1718 aa28.85■■■□□ 2.21
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.75■■■□□ 2.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.75■■■□□ 2.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.71■■■□□ 2.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 ABCC8Q09428 1581 aa28.69■■■□□ 2.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 ERCC6Q03468 1493 aa28.66■■■□□ 2.18
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRIM41Q8WV44 630 aa28.61■■■□□ 2.17
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.6■■■□□ 2.17
TOP3BP1-201ENST00000420768 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.54■■■□□ 2.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 CUX1P39880 1505 aa28.54■■■□□ 2.16
TOP3BP1-201ENST00000420768 SYNJ1O43426 1573 aa28.51■■■□□ 2.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 TOP2BQ02880 1626 aa28.5■■■□□ 2.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.49■■■□□ 2.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 TOPBP1Q92547 1522 aa28.47■■■□□ 2.15
TOP3BP1-201ENST00000420768 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.45■■■□□ 2.14
TOP3BP1-201ENST00000420768 WDR62O43379 1518 aa28.4■■■□□ 2.14
TOP3BP1-201ENST00000420768 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.33■■■□□ 2.13
TOP3BP1-201ENST00000420768 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
TOP3BP1-201ENST00000420768 SOGA1O94964 1423 aa28.22■■■□□ 2.11
TOP3BP1-201ENST00000420768 CUX2O14529 1486 aa28.15■■■□□ 2.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.14■■■□□ 2.1
TOP3BP1-201ENST00000420768 IFT140Q96RY7 1462 aa28.13■■■□□ 2.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.12■■■□□ 2.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 EEA1Q15075 1411 aa28.08■■■□□ 2.09
TOP3BP1-201ENST00000420768 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIF27Q86VH2 1401 aa28.06■■■□□ 2.08
TOP3BP1-201ENST00000420768 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.97■■■□□ 2.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 WDR97A6NE52 1622 aa27.96■■■□□ 2.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.07
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
TOP3BP1-201ENST00000420768 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.91■■■□□ 2.06
TOP3BP1-201ENST00000420768 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.89■■■□□ 2.06
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.05
TOP3BP1-201ENST00000420768 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.87■■■□□ 2.05
TOP3BP1-201ENST00000420768 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.86■■■□□ 2.05
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGF1RP08069 1367 aa27.84■■■□□ 2.05
TOP3BP1-201ENST00000420768 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.79■■■□□ 2.04
TOP3BP1-201ENST00000420768 GRIN2BQ13224 1484 aa27.79■■■□□ 2.04
TOP3BP1-201ENST00000420768 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRXQ9BXM0 1461 aa27.7■■■□□ 2.03
TOP3BP1-201ENST00000420768 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.7■■■□□ 2.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 CUL7Q14999 1698 aa27.65■■■□□ 2.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 PBRM1Q86U86 1689 aa27.65■■■□□ 2.02
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIF21BO75037 1637 aa27.63■■■□□ 2.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.62■■■□□ 2.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.61■■■□□ 2.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.61■■■□□ 2.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 GOLGA3Q08378 1498 aa27.59■■■□□ 2.01
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADAMTS12P58397 1594 aa27.56■■■□□ 2
TOP3BP1-201ENST00000420768 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.54■■■□□ 2
TOP3BP1-201ENST00000420768 SYNJ2O15056 1496 aa27.52■■■□□ 2
TOP3BP1-201ENST00000420768 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.49■■□□□ 1.99
TOP3BP1-201ENST00000420768 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
TOP3BP1-201ENST00000420768 GRIN2AQ12879 1464 aa27.42■■□□□ 1.98
TOP3BP1-201ENST00000420768 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.41■■□□□ 1.98
TOP3BP1-201ENST00000420768 FBLN2P98095 1184 aa27.39■■□□□ 1.98
TOP3BP1-201ENST00000420768 NUP160Q12769 1436 aa27.28■■□□□ 1.96
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.23■■□□□ 1.95
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