RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262622.4

CHST8-201, Transcript of carbohydrate sulfotransferase 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHST8, Length 2,479 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST8-201ENST00000262622 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.72■■■■□ 3.31
CHST8-201ENST00000262622 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.45■■■□□ 2.46
CHST8-201ENST00000262622 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.41■■■□□ 2.46
CHST8-201ENST00000262622 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
CHST8-201ENST00000262622 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.75■■■□□ 2.35
CHST8-201ENST00000262622 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
CHST8-201ENST00000262622 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.24■■■□□ 2.27
CHST8-201ENST00000262622 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.8■■■□□ 2.2
CHST8-201ENST00000262622 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.71■■■□□ 2.19
CHST8-201ENST00000262622 SCRIBQ14160 1630 aa28.58■■■□□ 2.17
CHST8-201ENST00000262622 ABCC9O60706 1549 aa28.46■■■□□ 2.15
CHST8-201ENST00000262622 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
CHST8-201ENST00000262622 NACADO15069 1562 aa28.15■■■□□ 2.1
CHST8-201ENST00000262622 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28■■■□□ 2.07
CHST8-201ENST00000262622 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.95■■■□□ 2.06
CHST8-201ENST00000262622 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.94■■■□□ 2.06
CHST8-201ENST00000262622 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.81■■■□□ 2.04
CHST8-201ENST00000262622 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.77■■■□□ 2.04
CHST8-201ENST00000262622 WIZO95785 1651 aa27.67■■■□□ 2.02
CHST8-201ENST00000262622 TRIM41Q8WV44 630 aa27.67■■■□□ 2.02
CHST8-201ENST00000262622 HRCP23327 699 aa27.6■■■□□ 2.01
CHST8-201ENST00000262622 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
CHST8-201ENST00000262622 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
CHST8-201ENST00000262622 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
CHST8-201ENST00000262622 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.42■■□□□ 1.98
CHST8-201ENST00000262622 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.35■■□□□ 1.97
CHST8-201ENST00000262622 SMARCA4P51532 1647 aa27.25■■□□□ 1.95
CHST8-201ENST00000262622 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
CHST8-201ENST00000262622 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
CHST8-201ENST00000262622 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.17■■□□□ 1.94
CHST8-201ENST00000262622 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
CHST8-201ENST00000262622 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
CHST8-201ENST00000262622 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.09■■□□□ 1.93
CHST8-201ENST00000262622 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.06■■□□□ 1.92
CHST8-201ENST00000262622 SMARCA2P51531 1590 aa27.05■■□□□ 1.92
CHST8-201ENST00000262622 ABCC8Q09428 1581 aa27.01■■□□□ 1.91
CHST8-201ENST00000262622 SOGA1O94964 1423 aa26.71■■□□□ 1.87
CHST8-201ENST00000262622 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.69■■□□□ 1.86
CHST8-201ENST00000262622 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.61■■□□□ 1.85
CHST8-201ENST00000262622 MYT1Q01538 1121 aa26.61■■□□□ 1.85
CHST8-201ENST00000262622 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.59■■□□□ 1.85
CHST8-201ENST00000262622 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
CHST8-201ENST00000262622 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.5■■□□□ 1.83
CHST8-201ENST00000262622 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.48■■□□□ 1.83
CHST8-201ENST00000262622 CEP162Q5TB80 1403 aa26.47■■□□□ 1.83
CHST8-201ENST00000262622 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.83
CHST8-201ENST00000262622 SYNJ1O43426 1573 aa26.43■■□□□ 1.82
CHST8-201ENST00000262622 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
CHST8-201ENST00000262622 EEA1Q15075 1411 aa26.41■■□□□ 1.82
CHST8-201ENST00000262622 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.39■■□□□ 1.82
CHST8-201ENST00000262622 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
CHST8-201ENST00000262622 GOLGA3Q08378 1498 aa26.29■■□□□ 1.8
CHST8-201ENST00000262622 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
CHST8-201ENST00000262622 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
CHST8-201ENST00000262622 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.14■■□□□ 1.78
CHST8-201ENST00000262622 KIF21BO75037 1637 aa26.12■■□□□ 1.77
CHST8-201ENST00000262622 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
CHST8-201ENST00000262622 TOP2BQ02880 1626 aa26.07■■□□□ 1.76
CHST8-201ENST00000262622 NCAPD3P42695 1498 aa26.06■■□□□ 1.76
CHST8-201ENST00000262622 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.05■■□□□ 1.76
CHST8-201ENST00000262622 HMGXB3Q12766 1538 aa26.04■■□□□ 1.76
CHST8-201ENST00000262622 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
CHST8-201ENST00000262622 CLIP1P30622 1438 aa26■■□□□ 1.75
CHST8-201ENST00000262622 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.97■■□□□ 1.75
CHST8-201ENST00000262622 CUX1P39880 1505 aa25.89■■□□□ 1.74
CHST8-201ENST00000262622 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.85■■□□□ 1.73
CHST8-201ENST00000262622 CFTRP13569 1480 aa25.83■■□□□ 1.73
CHST8-201ENST00000262622 PRXQ9BXM0 1461 aa25.77■■□□□ 1.72
CHST8-201ENST00000262622 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
CHST8-201ENST00000262622 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.71■■□□□ 1.71
CHST8-201ENST00000262622 APLP2Q06481 763 aa25.71■■□□□ 1.71
CHST8-201ENST00000262622 KIF27Q86VH2 1401 aa25.68■■□□□ 1.7
CHST8-201ENST00000262622 ARAP1Q96P48 1450 aa25.63■■□□□ 1.69
CHST8-201ENST00000262622 PRDM2Q13029 1718 aa25.61■■□□□ 1.69
CHST8-201ENST00000262622 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.58■■□□□ 1.68
CHST8-201ENST00000262622 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.56■■□□□ 1.68
CHST8-201ENST00000262622 CUX2O14529 1486 aa25.52■■□□□ 1.68
CHST8-201ENST00000262622 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
CHST8-201ENST00000262622 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
CHST8-201ENST00000262622 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
CHST8-201ENST00000262622 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.45■■□□□ 1.67
CHST8-201ENST00000262622 IGF1RP08069 1367 aa25.45■■□□□ 1.66
CHST8-201ENST00000262622 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.43■■□□□ 1.66
CHST8-201ENST00000262622 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.36■■□□□ 1.65
CHST8-201ENST00000262622 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
CHST8-201ENST00000262622 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.33■■□□□ 1.64
CHST8-201ENST00000262622 NEUROD1Q13562 356 aa25.3■■□□□ 1.64
CHST8-201ENST00000262622 NESP48681 1621 aa25.29■■□□□ 1.64
CHST8-201ENST00000262622 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.25■■□□□ 1.63
CHST8-201ENST00000262622 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.22■■□□□ 1.63
CHST8-201ENST00000262622 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CHST8-201ENST00000262622 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.19■■□□□ 1.62
CHST8-201ENST00000262622 TOPBP1Q92547 1522 aa25.17■■□□□ 1.62
CHST8-201ENST00000262622 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CHST8-201ENST00000262622 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
CHST8-201ENST00000262622 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
CHST8-201ENST00000262622 P3H3Q8IVL6 736 aa25.16■■□□□ 1.62
CHST8-201ENST00000262622 ITGAEP38570 1179 aa25.15■■□□□ 1.62
CHST8-201ENST00000262622 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.14■■□□□ 1.62
CHST8-201ENST00000262622 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 118.7 ms