Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FMODQ06828 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FMODQ06828 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FMODQ06828 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FMODQ06828 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FMODQ06828 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FMODQ06828 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FMODQ06828 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FMODQ06828 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FMODQ06828 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FMODQ06828 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FMODQ06828 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FMODQ06828 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FMODQ06828 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FMODQ06828 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FMODQ06828 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FMODQ06828 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FMODQ06828 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FMODQ06828 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FMODQ06828 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FMODQ06828 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FMODQ06828 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FMODQ06828 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FMODQ06828 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FMODQ06828 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FMODQ06828 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FMODQ06828 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FMODQ06828 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FMODQ06828 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FMODQ06828 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
FMODQ06828 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FMODQ06828 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
FMODQ06828 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FMODQ06828 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FMODQ06828 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FMODQ06828 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
FMODQ06828 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FMODQ06828 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
FMODQ06828 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FMODQ06828 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
FMODQ06828 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
FMODQ06828 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FMODQ06828 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
FMODQ06828 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FMODQ06828 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FMODQ06828 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FMODQ06828 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FMODQ06828 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FMODQ06828 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FMODQ06828 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FMODQ06828 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FMODQ06828 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FMODQ06828 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FMODQ06828 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FMODQ06828 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FMODQ06828 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FMODQ06828 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FMODQ06828 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms