Protein–RNA interactions for Protein: P0C1Z6

TFPT, TCF3 fusion partner, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFPTP0C1Z6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TFPTP0C1Z6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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