RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465846.6

HOXB-AS3-203, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 434 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.34■■■■■ 4.85
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.6■■■■■ 4.09
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ABCC9O60706 1549 aa40.25■■■■■ 4.03
HOXB-AS3-203ENST00000465846 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38.88■■■■□ 3.81
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.47■■■■□ 3.75
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NACADO15069 1562 aa38.27■■■■□ 3.72
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.04■■■■□ 3.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.86■■■■□ 3.65
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.68■■■■□ 3.62
HOXB-AS3-203ENST00000465846 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.63■■■■□ 3.61
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.61■■■■□ 3.61
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.49■■■■□ 3.59
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.48■■■■□ 3.59
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.43■■■■□ 3.58
HOXB-AS3-203ENST00000465846 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.34■■■■□ 3.57
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SCRIBQ14160 1630 aa37■■■■□ 3.51
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.89■■■■□ 3.5
HOXB-AS3-203ENST00000465846 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.4■■■■□ 3.42
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.23■■■■□ 3.39
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SMARCA4P51532 1647 aa35.33■■■■□ 3.25
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NCAPD3P42695 1498 aa35.31■■■■□ 3.24
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.26■■■■□ 3.23
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SMARCA2P51531 1590 aa35.2■■■■□ 3.23
HOXB-AS3-203ENST00000465846 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.19■■■■□ 3.22
HOXB-AS3-203ENST00000465846 HMGXB3Q12766 1538 aa35.12■■■■□ 3.21
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.99■■■■□ 3.19
HOXB-AS3-203ENST00000465846 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.95■■■■□ 3.19
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.94■■■■□ 3.18
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ERCC6Q03468 1493 aa34.74■■■■□ 3.15
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NESP48681 1621 aa34.66■■■■□ 3.14
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CUX2O14529 1486 aa34.58■■■■□ 3.13
HOXB-AS3-203ENST00000465846 WIZO95785 1651 aa34.54■■■■□ 3.12
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.5■■■■□ 3.11
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
HOXB-AS3-203ENST00000465846 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.27■■■■□ 3.08
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.26■■■■□ 3.07
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.24■■■■□ 3.07
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.13■■■■□ 3.05
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.97■■■■□ 3.03
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CFTRP13569 1480 aa33.94■■■■□ 3.02
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.9■■■■□ 3.02
HOXB-AS3-203ENST00000465846 WDR62O43379 1518 aa33.89■■■■□ 3.02
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.88■■■■□ 3.01
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.72■■■□□ 2.99
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PRDM2Q13029 1718 aa33.69■■■□□ 2.98
HOXB-AS3-203ENST00000465846 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.59■■■□□ 2.97
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TOPBP1Q92547 1522 aa33.28■■■□□ 2.92
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ABCC8Q09428 1581 aa33.21■■■□□ 2.91
HOXB-AS3-203ENST00000465846 IFT140Q96RY7 1462 aa33.2■■■□□ 2.91
HOXB-AS3-203ENST00000465846 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.2■■■□□ 2.91
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.12■■■□□ 2.89
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP33.07■■■□□ 2.88
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP33■■■□□ 2.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.99■■■□□ 2.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.97■■■□□ 2.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 OSCARQ8IYS5 282 aa32.97■■■□□ 2.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.97■■■□□ 2.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.96■■■□□ 2.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.83■■■□□ 2.85
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CUX1P39880 1505 aa32.82■■■□□ 2.85
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.82■■■□□ 2.84
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.8■■■□□ 2.84
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TRIM41Q8WV44 630 aa32.78■■■□□ 2.84
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SOGA1O94964 1423 aa32.77■■■□□ 2.84
HOXB-AS3-203ENST00000465846 WDR97A6NE52 1622 aa32.68■■■□□ 2.82
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CHD1O14646 1710 aa32.68■■■□□ 2.82
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.67■■■□□ 2.82
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.6■■■□□ 2.81
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.6■■■□□ 2.81
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.6■■■□□ 2.81
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.55■■■□□ 2.8
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ARHGEF11O15085 1522 aa32.52■■■□□ 2.8
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FBLN2P98095 1184 aa32.52■■■□□ 2.8
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GRIN2BQ13224 1484 aa32.48■■■□□ 2.79
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.47■■■□□ 2.79
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.45■■■□□ 2.78
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PBRM1Q86U86 1689 aa32.43■■■□□ 2.78
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.41■■■□□ 2.78
HOXB-AS3-203ENST00000465846 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.4■■■□□ 2.78
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.4■■■□□ 2.78
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TOP2BQ02880 1626 aa32.39■■■□□ 2.78
HOXB-AS3-203ENST00000465846 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.38■■■□□ 2.77
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SYNJ1O43426 1573 aa32.36■■■□□ 2.77
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SYNJ2O15056 1496 aa32.35■■■□□ 2.77
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.34■■■□□ 2.77
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.31■■■□□ 2.76
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ARAP1Q96P48 1450 aa32.23■■■□□ 2.75
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.19■■■□□ 2.74
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ADAMTS12P58397 1594 aa32.14■■■□□ 2.74
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GRIN2AQ12879 1464 aa32.08■■■□□ 2.73
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.05■■■□□ 2.72
HOXB-AS3-203ENST00000465846 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.01■■■□□ 2.72
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CEP170Q5SW79 1584 aa31.97■■■□□ 2.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NUP160Q12769 1436 aa31.96■■■□□ 2.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.81■■■□□ 2.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SHROOM2Q13796 1616 aa31.8■■■□□ 2.68
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.73■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms