RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622520.1

NFIB-212, Transcript of nuclear factor I B, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NFIB, Length 1,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIB-212ENST00000622520 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.52■■■■■ 4.24
NFIB-212ENST00000622520 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.63■■■■□ 3.45
NFIB-212ENST00000622520 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
NFIB-212ENST00000622520 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.41■■■■□ 3.26
NFIB-212ENST00000622520 ABCC9O60706 1549 aa35.37■■■■□ 3.25
NFIB-212ENST00000622520 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.72■■■■□ 3.15
NFIB-212ENST00000622520 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.46■■■■□ 3.11
NFIB-212ENST00000622520 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.34■■■■□ 3.09
NFIB-212ENST00000622520 NACADO15069 1562 aa34.3■■■■□ 3.08
NFIB-212ENST00000622520 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.25■■■■□ 3.07
NFIB-212ENST00000622520 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.21■■■■□ 3.07
NFIB-212ENST00000622520 SCRIBQ14160 1630 aa33.55■■■□□ 2.96
NFIB-212ENST00000622520 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.48■■■□□ 2.95
NFIB-212ENST00000622520 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.22■■■□□ 2.91
NFIB-212ENST00000622520 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.21■■■□□ 2.91
NFIB-212ENST00000622520 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.15■■■□□ 2.9
NFIB-212ENST00000622520 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.33■■■□□ 2.77
NFIB-212ENST00000622520 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.26■■■□□ 2.75
NFIB-212ENST00000622520 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.12■■■□□ 2.73
NFIB-212ENST00000622520 SMARCA4P51532 1647 aa32.11■■■□□ 2.73
NFIB-212ENST00000622520 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.04■■■□□ 2.72
NFIB-212ENST00000622520 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32■■■□□ 2.71
NFIB-212ENST00000622520 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.96■■■□□ 2.71
NFIB-212ENST00000622520 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.86■■■□□ 2.69
NFIB-212ENST00000622520 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.78■■■□□ 2.68
NFIB-212ENST00000622520 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.75■■■□□ 2.67
NFIB-212ENST00000622520 SMARCA2P51531 1590 aa31.74■■■□□ 2.67
NFIB-212ENST00000622520 WIZO95785 1651 aa31.73■■■□□ 2.67
NFIB-212ENST00000622520 NCAPD3P42695 1498 aa31.65■■■□□ 2.66
NFIB-212ENST00000622520 HMGXB3Q12766 1538 aa31.56■■■□□ 2.64
NFIB-212ENST00000622520 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
NFIB-212ENST00000622520 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.5■■■□□ 2.63
NFIB-212ENST00000622520 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
NFIB-212ENST00000622520 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.59
NFIB-212ENST00000622520 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.03■■■□□ 2.56
NFIB-212ENST00000622520 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP30.99■■■□□ 2.55
NFIB-212ENST00000622520 NESP48681 1621 aa30.79■■■□□ 2.52
NFIB-212ENST00000622520 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.77■■■□□ 2.52
NFIB-212ENST00000622520 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.72■■■□□ 2.51
NFIB-212ENST00000622520 CFTRP13569 1480 aa30.7■■■□□ 2.51
NFIB-212ENST00000622520 PRDM2Q13029 1718 aa30.51■■■□□ 2.47
NFIB-212ENST00000622520 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.48■■■□□ 2.47
NFIB-212ENST00000622520 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.44■■■□□ 2.46
NFIB-212ENST00000622520 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.42■■■□□ 2.46
NFIB-212ENST00000622520 ERCC6Q03468 1493 aa30.41■■■□□ 2.46
NFIB-212ENST00000622520 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.34■■■□□ 2.45
NFIB-212ENST00000622520 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
NFIB-212ENST00000622520 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.18■■■□□ 2.42
NFIB-212ENST00000622520 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
NFIB-212ENST00000622520 ABCC8Q09428 1581 aa30.11■■■□□ 2.41
NFIB-212ENST00000622520 WDR62O43379 1518 aa30.06■■■□□ 2.4
NFIB-212ENST00000622520 CUX1P39880 1505 aa30.03■■■□□ 2.4
NFIB-212ENST00000622520 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.03■■■□□ 2.4
NFIB-212ENST00000622520 TOPBP1Q92547 1522 aa30.02■■■□□ 2.4
NFIB-212ENST00000622520 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.01■■■□□ 2.39
NFIB-212ENST00000622520 SYNJ1O43426 1573 aa29.95■■■□□ 2.39
NFIB-212ENST00000622520 TOP2BQ02880 1626 aa29.89■■■□□ 2.37
NFIB-212ENST00000622520 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.89■■■□□ 2.37
NFIB-212ENST00000622520 CUX2O14529 1486 aa29.86■■■□□ 2.37
NFIB-212ENST00000622520 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.82■■■□□ 2.36
NFIB-212ENST00000622520 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
NFIB-212ENST00000622520 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.69■■■□□ 2.34
NFIB-212ENST00000622520 TRIM41Q8WV44 630 aa29.67■■■□□ 2.34
NFIB-212ENST00000622520 SOGA1O94964 1423 aa29.67■■■□□ 2.34
NFIB-212ENST00000622520 IFT140Q96RY7 1462 aa29.67■■■□□ 2.34
NFIB-212ENST00000622520 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
NFIB-212ENST00000622520 WDR97A6NE52 1622 aa29.55■■■□□ 2.32
NFIB-212ENST00000622520 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.54■■■□□ 2.32
NFIB-212ENST00000622520 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
NFIB-212ENST00000622520 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
NFIB-212ENST00000622520 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
NFIB-212ENST00000622520 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.42■■■□□ 2.3
NFIB-212ENST00000622520 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.39■■■□□ 2.3
NFIB-212ENST00000622520 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.35■■■□□ 2.29
NFIB-212ENST00000622520 KIF27Q86VH2 1401 aa29.32■■■□□ 2.28
NFIB-212ENST00000622520 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.3■■■□□ 2.28
NFIB-212ENST00000622520 PBRM1Q86U86 1689 aa29.26■■■□□ 2.27
NFIB-212ENST00000622520 GRIN2BQ13224 1484 aa29.26■■■□□ 2.27
NFIB-212ENST00000622520 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.18■■■□□ 2.26
NFIB-212ENST00000622520 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.17■■■□□ 2.26
NFIB-212ENST00000622520 IGF1RP08069 1367 aa29.15■■■□□ 2.26
NFIB-212ENST00000622520 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
NFIB-212ENST00000622520 EEA1Q15075 1411 aa29.11■■■□□ 2.25
NFIB-212ENST00000622520 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
NFIB-212ENST00000622520 ADAMTS12P58397 1594 aa29.08■■■□□ 2.25
NFIB-212ENST00000622520 CUL7Q14999 1698 aa29.02■■■□□ 2.24
NFIB-212ENST00000622520 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.02■■■□□ 2.24
NFIB-212ENST00000622520 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.02■■■□□ 2.24
NFIB-212ENST00000622520 SYNJ2O15056 1496 aa29■■■□□ 2.23
NFIB-212ENST00000622520 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.99■■■□□ 2.23
NFIB-212ENST00000622520 CHD1O14646 1710 aa28.95■■■□□ 2.23
NFIB-212ENST00000622520 FBLN2P98095 1184 aa28.94■■■□□ 2.22
NFIB-212ENST00000622520 PRXQ9BXM0 1461 aa28.92■■■□□ 2.22
NFIB-212ENST00000622520 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
NFIB-212ENST00000622520 GRIN2AQ12879 1464 aa28.9■■■□□ 2.22
NFIB-212ENST00000622520 FOXD1Q16676 465 aa28.88■■■□□ 2.21
NFIB-212ENST00000622520 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.87■■■□□ 2.21
NFIB-212ENST00000622520 KIF21BO75037 1637 aa28.82■■■□□ 2.2
NFIB-212ENST00000622520 CEP170Q5SW79 1584 aa28.75■■■□□ 2.19
NFIB-212ENST00000622520 NUP160Q12769 1436 aa28.74■■■□□ 2.19
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