Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLCO3A1Q9UIG8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLCO3A1Q9UIG8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLCO3A1Q9UIG8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLCO3A1Q9UIG8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLCO3A1Q9UIG8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLCO3A1Q9UIG8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLCO3A1Q9UIG8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLCO3A1Q9UIG8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLCO3A1Q9UIG8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLCO3A1Q9UIG8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLCO3A1Q9UIG8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLCO3A1Q9UIG8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLCO3A1Q9UIG8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLCO3A1Q9UIG8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLCO3A1Q9UIG8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLCO3A1Q9UIG8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLCO3A1Q9UIG8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLCO3A1Q9UIG8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLCO3A1Q9UIG8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLCO3A1Q9UIG8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLCO3A1Q9UIG8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLCO3A1Q9UIG8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLCO3A1Q9UIG8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLCO3A1Q9UIG8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLCO3A1Q9UIG8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLCO3A1Q9UIG8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLCO3A1Q9UIG8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLCO3A1Q9UIG8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLCO3A1Q9UIG8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLCO3A1Q9UIG8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLCO3A1Q9UIG8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLCO3A1Q9UIG8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLCO3A1Q9UIG8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLCO3A1Q9UIG8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLCO3A1Q9UIG8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLCO3A1Q9UIG8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLCO3A1Q9UIG8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLCO3A1Q9UIG8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLCO3A1Q9UIG8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLCO3A1Q9UIG8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLCO3A1Q9UIG8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLCO3A1Q9UIG8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLCO3A1Q9UIG8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLCO3A1Q9UIG8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLCO3A1Q9UIG8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLCO3A1Q9UIG8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLCO3A1Q9UIG8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLCO3A1Q9UIG8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms