Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BHMTQ93088 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BHMTQ93088 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BHMTQ93088 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BHMTQ93088 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BHMTQ93088 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BHMTQ93088 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BHMTQ93088 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BHMTQ93088 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BHMTQ93088 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BHMTQ93088 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BHMTQ93088 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BHMTQ93088 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BHMTQ93088 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BHMTQ93088 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BHMTQ93088 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BHMTQ93088 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BHMTQ93088 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BHMTQ93088 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BHMTQ93088 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BHMTQ93088 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BHMTQ93088 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BHMTQ93088 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BHMTQ93088 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BHMTQ93088 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BHMTQ93088 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BHMTQ93088 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BHMTQ93088 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BHMTQ93088 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BHMTQ93088 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BHMTQ93088 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BHMTQ93088 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BHMTQ93088 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BHMTQ93088 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BHMTQ93088 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BHMTQ93088 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BHMTQ93088 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BHMTQ93088 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BHMTQ93088 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BHMTQ93088 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BHMTQ93088 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BHMTQ93088 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BHMTQ93088 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BHMTQ93088 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BHMTQ93088 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BHMTQ93088 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BHMTQ93088 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BHMTQ93088 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BHMTQ93088 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BHMTQ93088 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
BHMTQ93088 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BHMTQ93088 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BHMTQ93088 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BHMTQ93088 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BHMTQ93088 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BHMTQ93088 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BHMTQ93088 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BHMTQ93088 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BHMTQ93088 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BHMTQ93088 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BHMTQ93088 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BHMTQ93088 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BHMTQ93088 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BHMTQ93088 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BHMTQ93088 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BHMTQ93088 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BHMTQ93088 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BHMTQ93088 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BHMTQ93088 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BHMTQ93088 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BHMTQ93088 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BHMTQ93088 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BHMTQ93088 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BHMTQ93088 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BHMTQ93088 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BHMTQ93088 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BHMTQ93088 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BHMTQ93088 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BHMTQ93088 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BHMTQ93088 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BHMTQ93088 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BHMTQ93088 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BHMTQ93088 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BHMTQ93088 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BHMTQ93088 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BHMTQ93088 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms