Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI8

TMC1, Transmembrane channel-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC1Q8TDI8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
TMC1Q8TDI8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TMC1Q8TDI8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TMC1Q8TDI8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TMC1Q8TDI8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TMC1Q8TDI8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TMC1Q8TDI8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
TMC1Q8TDI8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TMC1Q8TDI8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TMC1Q8TDI8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TMC1Q8TDI8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
TMC1Q8TDI8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TMC1Q8TDI8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TMC1Q8TDI8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
TMC1Q8TDI8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TMC1Q8TDI8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TMC1Q8TDI8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TMC1Q8TDI8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TMC1Q8TDI8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
TMC1Q8TDI8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
TMC1Q8TDI8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TMC1Q8TDI8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TMC1Q8TDI8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TMC1Q8TDI8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TMC1Q8TDI8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TMC1Q8TDI8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TMC1Q8TDI8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TMC1Q8TDI8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TMC1Q8TDI8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TMC1Q8TDI8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TMC1Q8TDI8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TMC1Q8TDI8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TMC1Q8TDI8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TMC1Q8TDI8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
TMC1Q8TDI8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TMC1Q8TDI8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TMC1Q8TDI8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TMC1Q8TDI8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
TMC1Q8TDI8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TMC1Q8TDI8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TMC1Q8TDI8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TMC1Q8TDI8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
TMC1Q8TDI8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TMC1Q8TDI8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TMC1Q8TDI8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TMC1Q8TDI8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TMC1Q8TDI8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TMC1Q8TDI8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
TMC1Q8TDI8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TMC1Q8TDI8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TMC1Q8TDI8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TMC1Q8TDI8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TMC1Q8TDI8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
TMC1Q8TDI8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TMC1Q8TDI8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TMC1Q8TDI8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TMC1Q8TDI8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
TMC1Q8TDI8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
TMC1Q8TDI8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
TMC1Q8TDI8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
TMC1Q8TDI8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TMC1Q8TDI8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TMC1Q8TDI8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TMC1Q8TDI8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
TMC1Q8TDI8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TMC1Q8TDI8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TMC1Q8TDI8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TMC1Q8TDI8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TMC1Q8TDI8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TMC1Q8TDI8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TMC1Q8TDI8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TMC1Q8TDI8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TMC1Q8TDI8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TMC1Q8TDI8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TMC1Q8TDI8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TMC1Q8TDI8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
TMC1Q8TDI8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TMC1Q8TDI8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TMC1Q8TDI8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TMC1Q8TDI8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TMC1Q8TDI8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TMC1Q8TDI8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
TMC1Q8TDI8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TMC1Q8TDI8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TMC1Q8TDI8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TMC1Q8TDI8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TMC1Q8TDI8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TMC1Q8TDI8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TMC1Q8TDI8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TMC1Q8TDI8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TMC1Q8TDI8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TMC1Q8TDI8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TMC1Q8TDI8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TMC1Q8TDI8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TMC1Q8TDI8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
TMC1Q8TDI8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TMC1Q8TDI8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TMC1Q8TDI8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TMC1Q8TDI8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TMC1Q8TDI8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms