Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC102BQ68D86 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC102BQ68D86 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC102BQ68D86 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC102BQ68D86 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC102BQ68D86 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC102BQ68D86 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC102BQ68D86 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC102BQ68D86 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC102BQ68D86 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC102BQ68D86 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC102BQ68D86 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC102BQ68D86 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC102BQ68D86 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC102BQ68D86 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC102BQ68D86 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC102BQ68D86 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC102BQ68D86 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC102BQ68D86 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC102BQ68D86 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC102BQ68D86 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC102BQ68D86 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC102BQ68D86 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC102BQ68D86 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC102BQ68D86 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC102BQ68D86 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC102BQ68D86 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC102BQ68D86 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC102BQ68D86 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC102BQ68D86 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC102BQ68D86 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC102BQ68D86 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC102BQ68D86 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC102BQ68D86 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC102BQ68D86 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC102BQ68D86 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC102BQ68D86 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC102BQ68D86 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC102BQ68D86 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC102BQ68D86 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC102BQ68D86 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC102BQ68D86 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC102BQ68D86 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC102BQ68D86 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC102BQ68D86 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC102BQ68D86 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC102BQ68D86 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC102BQ68D86 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC102BQ68D86 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC102BQ68D86 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC102BQ68D86 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC102BQ68D86 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC102BQ68D86 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC102BQ68D86 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC102BQ68D86 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC102BQ68D86 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC102BQ68D86 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC102BQ68D86 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC102BQ68D86 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC102BQ68D86 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC102BQ68D86 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC102BQ68D86 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC102BQ68D86 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC102BQ68D86 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC102BQ68D86 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC102BQ68D86 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC102BQ68D86 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC102BQ68D86 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC102BQ68D86 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC102BQ68D86 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC102BQ68D86 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC102BQ68D86 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC102BQ68D86 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC102BQ68D86 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC102BQ68D86 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC102BQ68D86 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC102BQ68D86 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC102BQ68D86 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CCDC102BQ68D86 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC102BQ68D86 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC102BQ68D86 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC102BQ68D86 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC102BQ68D86 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC102BQ68D86 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC102BQ68D86 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC102BQ68D86 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC102BQ68D86 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC102BQ68D86 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC102BQ68D86 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC102BQ68D86 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC102BQ68D86 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC102BQ68D86 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC102BQ68D86 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC102BQ68D86 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC102BQ68D86 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC102BQ68D86 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC102BQ68D86 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC102BQ68D86 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC102BQ68D86 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC102BQ68D86 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms