Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VARSP26640 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
VARSP26640 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VARSP26640 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VARSP26640 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VARSP26640 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VARSP26640 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VARSP26640 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VARSP26640 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VARSP26640 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VARSP26640 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VARSP26640 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VARSP26640 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VARSP26640 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VARSP26640 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VARSP26640 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VARSP26640 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VARSP26640 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VARSP26640 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VARSP26640 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VARSP26640 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VARSP26640 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VARSP26640 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VARSP26640 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VARSP26640 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VARSP26640 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VARSP26640 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VARSP26640 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VARSP26640 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VARSP26640 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VARSP26640 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VARSP26640 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VARSP26640 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VARSP26640 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VARSP26640 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VARSP26640 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VARSP26640 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VARSP26640 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VARSP26640 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VARSP26640 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VARSP26640 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VARSP26640 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VARSP26640 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VARSP26640 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VARSP26640 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VARSP26640 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VARSP26640 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VARSP26640 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VARSP26640 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VARSP26640 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VARSP26640 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VARSP26640 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VARSP26640 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VARSP26640 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VARSP26640 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VARSP26640 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VARSP26640 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VARSP26640 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VARSP26640 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VARSP26640 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VARSP26640 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VARSP26640 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VARSP26640 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VARSP26640 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VARSP26640 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VARSP26640 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VARSP26640 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VARSP26640 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VARSP26640 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VARSP26640 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VARSP26640 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VARSP26640 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VARSP26640 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VARSP26640 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
VARSP26640 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VARSP26640 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VARSP26640 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VARSP26640 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VARSP26640 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VARSP26640 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VARSP26640 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VARSP26640 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VARSP26640 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VARSP26640 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VARSP26640 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VARSP26640 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VARSP26640 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VARSP26640 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VARSP26640 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VARSP26640 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VARSP26640 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VARSP26640 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VARSP26640 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VARSP26640 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VARSP26640 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
VARSP26640 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VARSP26640 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VARSP26640 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VARSP26640 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VARSP26640 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms