Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFKBIAP25963 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFKBIAP25963 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NFKBIAP25963 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NFKBIAP25963 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFKBIAP25963 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NFKBIAP25963 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFKBIAP25963 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFKBIAP25963 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NFKBIAP25963 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NFKBIAP25963 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFKBIAP25963 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NFKBIAP25963 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms