Protein–RNA interactions for Protein: P13010

XRCC5, X-ray repair cross-complementing protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC5P13010 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
XRCC5P13010 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
XRCC5P13010 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
XRCC5P13010 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
XRCC5P13010 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
XRCC5P13010 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
XRCC5P13010 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
XRCC5P13010 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
XRCC5P13010 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
XRCC5P13010 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
XRCC5P13010 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
XRCC5P13010 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
XRCC5P13010 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
XRCC5P13010 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
XRCC5P13010 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
XRCC5P13010 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
XRCC5P13010 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
XRCC5P13010 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
XRCC5P13010 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
XRCC5P13010 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
XRCC5P13010 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
XRCC5P13010 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
XRCC5P13010 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
XRCC5P13010 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
XRCC5P13010 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
XRCC5P13010 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
XRCC5P13010 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
XRCC5P13010 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
XRCC5P13010 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
XRCC5P13010 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
XRCC5P13010 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
XRCC5P13010 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
XRCC5P13010 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
XRCC5P13010 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
XRCC5P13010 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
XRCC5P13010 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
XRCC5P13010 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
XRCC5P13010 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
XRCC5P13010 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
XRCC5P13010 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
XRCC5P13010 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
XRCC5P13010 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
XRCC5P13010 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
XRCC5P13010 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
XRCC5P13010 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
XRCC5P13010 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
XRCC5P13010 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
XRCC5P13010 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
XRCC5P13010 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
XRCC5P13010 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
XRCC5P13010 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
XRCC5P13010 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
XRCC5P13010 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
XRCC5P13010 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
XRCC5P13010 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms