Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
POLR3DP05423 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLR3DP05423 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLR3DP05423 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR3DP05423 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR3DP05423 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR3DP05423 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR3DP05423 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR3DP05423 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR3DP05423 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR3DP05423 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR3DP05423 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR3DP05423 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR3DP05423 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR3DP05423 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR3DP05423 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR3DP05423 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR3DP05423 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR3DP05423 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR3DP05423 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR3DP05423 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR3DP05423 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR3DP05423 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR3DP05423 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR3DP05423 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR3DP05423 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
POLR3DP05423 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLR3DP05423 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLR3DP05423 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLR3DP05423 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
POLR3DP05423 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLR3DP05423 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLR3DP05423 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLR3DP05423 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLR3DP05423 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLR3DP05423 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR3DP05423 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR3DP05423 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR3DP05423 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR3DP05423 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR3DP05423 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR3DP05423 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR3DP05423 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR3DP05423 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
POLR3DP05423 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR3DP05423 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR3DP05423 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR3DP05423 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR3DP05423 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR3DP05423 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR3DP05423 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR3DP05423 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR3DP05423 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR3DP05423 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR3DP05423 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR3DP05423 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR3DP05423 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR3DP05423 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR3DP05423 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR3DP05423 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR3DP05423 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR3DP05423 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR3DP05423 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR3DP05423 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR3DP05423 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR3DP05423 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
POLR3DP05423 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
POLR3DP05423 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR3DP05423 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR3DP05423 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
POLR3DP05423 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR3DP05423 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR3DP05423 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR3DP05423 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR3DP05423 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR3DP05423 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLR3DP05423 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR3DP05423 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLR3DP05423 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms