Protein–RNA interactions for Protein: O60359

CACNG3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG3O60359 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNG3O60359 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNG3O60359 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNG3O60359 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNG3O60359 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNG3O60359 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CACNG3O60359 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNG3O60359 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNG3O60359 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130 ms