Protein–RNA interactions for Protein: O14544

SOCS6, Suppressor of cytokine signaling 6, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS6O14544 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOCS6O14544 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SOCS6O14544 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SOCS6O14544 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SOCS6O14544 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SOCS6O14544 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOCS6O14544 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOCS6O14544 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SOCS6O14544 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms