Protein–RNA interactions for Protein: B0FP48

UPK3BL1, Uroplakin-3b-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL1B0FP48 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UPK3BL1B0FP48 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
UPK3BL1B0FP48 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UPK3BL1B0FP48 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UPK3BL1B0FP48 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UPK3BL1B0FP48 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UPK3BL1B0FP48 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UPK3BL1B0FP48 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UPK3BL1B0FP48 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UPK3BL1B0FP48 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
UPK3BL1B0FP48 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UPK3BL1B0FP48 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UPK3BL1B0FP48 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UPK3BL1B0FP48 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UPK3BL1B0FP48 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UPK3BL1B0FP48 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UPK3BL1B0FP48 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UPK3BL1B0FP48 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UPK3BL1B0FP48 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UPK3BL1B0FP48 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UPK3BL1B0FP48 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UPK3BL1B0FP48 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UPK3BL1B0FP48 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UPK3BL1B0FP48 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UPK3BL1B0FP48 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UPK3BL1B0FP48 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UPK3BL1B0FP48 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UPK3BL1B0FP48 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UPK3BL1B0FP48 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UPK3BL1B0FP48 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UPK3BL1B0FP48 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UPK3BL1B0FP48 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UPK3BL1B0FP48 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UPK3BL1B0FP48 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPK3BL1B0FP48 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPK3BL1B0FP48 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPK3BL1B0FP48 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPK3BL1B0FP48 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPK3BL1B0FP48 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPK3BL1B0FP48 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPK3BL1B0FP48 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UPK3BL1B0FP48 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UPK3BL1B0FP48 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms