Protein–RNA interactions for Protein: A6NLU5

VSTM2B, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2BA6NLU5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
VSTM2BA6NLU5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSTM2BA6NLU5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSTM2BA6NLU5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSTM2BA6NLU5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VSTM2BA6NLU5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSTM2BA6NLU5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSTM2BA6NLU5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSTM2BA6NLU5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VSTM2BA6NLU5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSTM2BA6NLU5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VSTM2BA6NLU5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSTM2BA6NLU5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VSTM2BA6NLU5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSTM2BA6NLU5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSTM2BA6NLU5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSTM2BA6NLU5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSTM2BA6NLU5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VSTM2BA6NLU5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSTM2BA6NLU5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSTM2BA6NLU5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSTM2BA6NLU5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VSTM2BA6NLU5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSTM2BA6NLU5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSTM2BA6NLU5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSTM2BA6NLU5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSTM2BA6NLU5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSTM2BA6NLU5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSTM2BA6NLU5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSTM2BA6NLU5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VSTM2BA6NLU5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSTM2BA6NLU5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSTM2BA6NLU5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VSTM2BA6NLU5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VSTM2BA6NLU5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSTM2BA6NLU5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSTM2BA6NLU5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VSTM2BA6NLU5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSTM2BA6NLU5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSTM2BA6NLU5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSTM2BA6NLU5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VSTM2BA6NLU5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSTM2BA6NLU5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSTM2BA6NLU5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSTM2BA6NLU5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSTM2BA6NLU5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSTM2BA6NLU5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSTM2BA6NLU5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSTM2BA6NLU5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSTM2BA6NLU5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSTM2BA6NLU5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSTM2BA6NLU5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSTM2BA6NLU5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSTM2BA6NLU5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VSTM2BA6NLU5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSTM2BA6NLU5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VSTM2BA6NLU5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSTM2BA6NLU5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSTM2BA6NLU5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSTM2BA6NLU5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSTM2BA6NLU5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSTM2BA6NLU5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSTM2BA6NLU5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSTM2BA6NLU5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VSTM2BA6NLU5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSTM2BA6NLU5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSTM2BA6NLU5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VSTM2BA6NLU5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSTM2BA6NLU5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSTM2BA6NLU5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSTM2BA6NLU5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VSTM2BA6NLU5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VSTM2BA6NLU5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VSTM2BA6NLU5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms