Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHMG1C9JSJ3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms