RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452514.6

MEG3-211, Transcript of maternally expressed 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MEG3, Length 461 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEG3-211ENST00000452514 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43■■■■■ 4.47
MEG3-211ENST00000452514 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.14■■■■□ 3.7
MEG3-211ENST00000452514 ABCC9O60706 1549 aa37.04■■■■□ 3.52
MEG3-211ENST00000452514 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
MEG3-211ENST00000452514 NACADO15069 1562 aa35.77■■■■□ 3.32
MEG3-211ENST00000452514 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.75■■■■□ 3.31
MEG3-211ENST00000452514 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.71■■■■□ 3.31
MEG3-211ENST00000452514 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.66■■■■□ 3.3
MEG3-211ENST00000452514 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.61■■■■□ 3.29
MEG3-211ENST00000452514 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.98■■■■□ 3.19
MEG3-211ENST00000452514 SCRIBQ14160 1630 aa34.81■■■■□ 3.16
MEG3-211ENST00000452514 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.7■■■■□ 3.15
MEG3-211ENST00000452514 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.62■■■■□ 3.13
MEG3-211ENST00000452514 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.34■■■■□ 3.09
MEG3-211ENST00000452514 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.76■■■□□ 2.99
MEG3-211ENST00000452514 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.74■■■□□ 2.99
MEG3-211ENST00000452514 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.53■■■□□ 2.96
MEG3-211ENST00000452514 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.48■■■□□ 2.95
MEG3-211ENST00000452514 SMARCA4P51532 1647 aa33.33■■■□□ 2.93
MEG3-211ENST00000452514 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.3■■■□□ 2.92
MEG3-211ENST00000452514 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.16■■■□□ 2.9
MEG3-211ENST00000452514 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.06■■■□□ 2.88
MEG3-211ENST00000452514 SMARCA2P51531 1590 aa33.04■■■□□ 2.88
MEG3-211ENST00000452514 PEG3Q9GZU2 1588 aa33■■■□□ 2.87
MEG3-211ENST00000452514 NCAPD3P42695 1498 aa33■■■□□ 2.87
MEG3-211ENST00000452514 HMGXB3Q12766 1538 aa32.89■■■□□ 2.86
MEG3-211ENST00000452514 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.85■■■□□ 2.85
MEG3-211ENST00000452514 WIZO95785 1651 aa32.81■■■□□ 2.84
MEG3-211ENST00000452514 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.8■■■□□ 2.84
MEG3-211ENST00000452514 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.48■■■□□ 2.79
MEG3-211ENST00000452514 NESP48681 1621 aa32.15■■■□□ 2.74
MEG3-211ENST00000452514 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.14■■■□□ 2.74
MEG3-211ENST00000452514 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.1■■■□□ 2.73
MEG3-211ENST00000452514 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.08■■■□□ 2.73
MEG3-211ENST00000452514 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.05■■■□□ 2.72
MEG3-211ENST00000452514 CFTRP13569 1480 aa31.93■■■□□ 2.7
MEG3-211ENST00000452514 ERCC6Q03468 1493 aa31.89■■■□□ 2.7
MEG3-211ENST00000452514 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.84■■■□□ 2.69
MEG3-211ENST00000452514 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.78■■■□□ 2.68
MEG3-211ENST00000452514 PRDM2Q13029 1718 aa31.72■■■□□ 2.67
MEG3-211ENST00000452514 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.69■■■□□ 2.66
MEG3-211ENST00000452514 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.64■■■□□ 2.65
MEG3-211ENST00000452514 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.62■■■□□ 2.65
MEG3-211ENST00000452514 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.53■■■□□ 2.64
MEG3-211ENST00000452514 CUX2O14529 1486 aa31.49■■■□□ 2.63
MEG3-211ENST00000452514 WDR62O43379 1518 aa31.44■■■□□ 2.62
MEG3-211ENST00000452514 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.38■■■□□ 2.61
MEG3-211ENST00000452514 TOPBP1Q92547 1522 aa31.23■■■□□ 2.59
MEG3-211ENST00000452514 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.22■■■□□ 2.59
MEG3-211ENST00000452514 ABCC8Q09428 1581 aa31.19■■■□□ 2.58
MEG3-211ENST00000452514 CUX1P39880 1505 aa31.09■■■□□ 2.57
MEG3-211ENST00000452514 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
MEG3-211ENST00000452514 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.96■■■□□ 2.55
MEG3-211ENST00000452514 IFT140Q96RY7 1462 aa30.95■■■□□ 2.54
MEG3-211ENST00000452514 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.94■■■□□ 2.54
MEG3-211ENST00000452514 SYNJ1O43426 1573 aa30.91■■■□□ 2.54
MEG3-211ENST00000452514 TOP2BQ02880 1626 aa30.89■■■□□ 2.54
MEG3-211ENST00000452514 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.89■■■□□ 2.54
MEG3-211ENST00000452514 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
MEG3-211ENST00000452514 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.83■■■□□ 2.53
MEG3-211ENST00000452514 SOGA1O94964 1423 aa30.81■■■□□ 2.52
MEG3-211ENST00000452514 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
MEG3-211ENST00000452514 WDR97A6NE52 1622 aa30.71■■■□□ 2.51
MEG3-211ENST00000452514 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
MEG3-211ENST00000452514 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.65■■■□□ 2.5
MEG3-211ENST00000452514 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.63■■■□□ 2.49
MEG3-211ENST00000452514 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
MEG3-211ENST00000452514 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.53■■■□□ 2.48
MEG3-211ENST00000452514 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.48■■■□□ 2.47
MEG3-211ENST00000452514 GRIN2BQ13224 1484 aa30.44■■■□□ 2.46
MEG3-211ENST00000452514 PBRM1Q86U86 1689 aa30.43■■■□□ 2.46
MEG3-211ENST00000452514 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.38■■■□□ 2.45
MEG3-211ENST00000452514 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
MEG3-211ENST00000452514 TRIM41Q8WV44 630 aa30.33■■■□□ 2.45
MEG3-211ENST00000452514 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.28■■■□□ 2.44
MEG3-211ENST00000452514 KIF27Q86VH2 1401 aa30.27■■■□□ 2.44
MEG3-211ENST00000452514 CHD1O14646 1710 aa30.27■■■□□ 2.44
MEG3-211ENST00000452514 ADAMTS12P58397 1594 aa30.23■■■□□ 2.43
MEG3-211ENST00000452514 SYNJ2O15056 1496 aa30.22■■■□□ 2.43
MEG3-211ENST00000452514 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.18■■■□□ 2.42
MEG3-211ENST00000452514 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.17■■■□□ 2.42
MEG3-211ENST00000452514 OSCARQ8IYS5 282 aa30.17■■■□□ 2.42
MEG3-211ENST00000452514 FBLN2P98095 1184 aa30.16■■■□□ 2.42
MEG3-211ENST00000452514 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.13■■■□□ 2.41
MEG3-211ENST00000452514 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.13■■■□□ 2.41
MEG3-211ENST00000452514 IGF1RP08069 1367 aa30.13■■■□□ 2.41
MEG3-211ENST00000452514 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.11■■■□□ 2.41
MEG3-211ENST00000452514 GRIN2AQ12879 1464 aa30.06■■■□□ 2.4
MEG3-211ENST00000452514 CUL7Q14999 1698 aa30.06■■■□□ 2.4
MEG3-211ENST00000452514 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.96■■■□□ 2.39
MEG3-211ENST00000452514 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.94■■■□□ 2.38
MEG3-211ENST00000452514 NUP160Q12769 1436 aa29.94■■■□□ 2.38
MEG3-211ENST00000452514 CEP170Q5SW79 1584 aa29.93■■■□□ 2.38
MEG3-211ENST00000452514 EEA1Q15075 1411 aa29.87■■■□□ 2.37
MEG3-211ENST00000452514 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.8■■■□□ 2.36
MEG3-211ENST00000452514 PRXQ9BXM0 1461 aa29.79■■■□□ 2.36
MEG3-211ENST00000452514 CSRNP3Q8WYN3 585 aa29.76■■■□□ 2.35
MEG3-211ENST00000452514 ARHGEF11O15085 1522 aa29.75■■■□□ 2.35
MEG3-211ENST00000452514 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.73■■■□□ 2.35
MEG3-211ENST00000452514 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.73■■■□□ 2.35
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