RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580374.1

MIR3180-1-201, Transcript of microRNA 3180-1, humanhuman

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Gene MIR3180-1, Length 94 nt, Biotype miRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIR3180-1-201ENST00000580374 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.01■■■■■ 4.8
MIR3180-1-201ENST00000580374 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.2■■■■■ 4.03
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MIR3180-1-201ENST00000580374 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.03■■■■□ 3.68
MIR3180-1-201ENST00000580374 NACADO15069 1562 aa37.89■■■■□ 3.66
MIR3180-1-201ENST00000580374 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.66■■■■□ 3.62
MIR3180-1-201ENST00000580374 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.54■■■■□ 3.6
MIR3180-1-201ENST00000580374 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.39■■■■□ 3.58
MIR3180-1-201ENST00000580374 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.32■■■■□ 3.56
MIR3180-1-201ENST00000580374 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.21■■■■□ 3.55
MIR3180-1-201ENST00000580374 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.1■■■■□ 3.53
MIR3180-1-201ENST00000580374 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.07■■■■□ 3.52
MIR3180-1-201ENST00000580374 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.03■■■■□ 3.52
MIR3180-1-201ENST00000580374 SCRIBQ14160 1630 aa36.63■■■■□ 3.45
MIR3180-1-201ENST00000580374 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.46■■■■□ 3.43
MIR3180-1-201ENST00000580374 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
MIR3180-1-201ENST00000580374 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36■■■■□ 3.35
MIR3180-1-201ENST00000580374 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.79■■■■□ 3.32
MIR3180-1-201ENST00000580374 SMARCA4P51532 1647 aa35.02■■■■□ 3.2
MIR3180-1-201ENST00000580374 NCAPD3P42695 1498 aa35■■■■□ 3.19
MIR3180-1-201ENST00000580374 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.96■■■■□ 3.19
MIR3180-1-201ENST00000580374 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.86■■■■□ 3.17
MIR3180-1-201ENST00000580374 SMARCA2P51531 1590 aa34.83■■■■□ 3.17
MIR3180-1-201ENST00000580374 HMGXB3Q12766 1538 aa34.76■■■■□ 3.16
MIR3180-1-201ENST00000580374 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.7■■■■□ 3.15
MIR3180-1-201ENST00000580374 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.7■■■■□ 3.14
MIR3180-1-201ENST00000580374 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.58■■■■□ 3.13
MIR3180-1-201ENST00000580374 NESP48681 1621 aa34.33■■■■□ 3.09
MIR3180-1-201ENST00000580374 WIZO95785 1651 aa34.3■■■■□ 3.08
MIR3180-1-201ENST00000580374 ERCC6Q03468 1493 aa34.24■■■■□ 3.07
MIR3180-1-201ENST00000580374 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.12■■■■□ 3.05
MIR3180-1-201ENST00000580374 CUX2O14529 1486 aa34.12■■■■□ 3.05
MIR3180-1-201ENST00000580374 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.12■■■■□ 3.05
MIR3180-1-201ENST00000580374 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.93■■■■□ 3.02
MIR3180-1-201ENST00000580374 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.92■■■■□ 3.02
MIR3180-1-201ENST00000580374 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.92■■■■□ 3.02
MIR3180-1-201ENST00000580374 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.87■■■■□ 3.01
MIR3180-1-201ENST00000580374 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.86■■■■□ 3.01
MIR3180-1-201ENST00000580374 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.68■■■□□ 2.98
MIR3180-1-201ENST00000580374 CFTRP13569 1480 aa33.65■■■□□ 2.98
MIR3180-1-201ENST00000580374 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.58■■■□□ 2.97
MIR3180-1-201ENST00000580374 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.53■■■□□ 2.96
MIR3180-1-201ENST00000580374 WDR62O43379 1518 aa33.53■■■□□ 2.96
MIR3180-1-201ENST00000580374 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.5■■■□□ 2.95
MIR3180-1-201ENST00000580374 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.49■■■□□ 2.95
MIR3180-1-201ENST00000580374 PRDM2Q13029 1718 aa33.38■■■□□ 2.93
MIR3180-1-201ENST00000580374 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.28■■■□□ 2.92
MIR3180-1-201ENST00000580374 TOPBP1Q92547 1522 aa32.97■■■□□ 2.87
MIR3180-1-201ENST00000580374 ABCC8Q09428 1581 aa32.87■■■□□ 2.85
MIR3180-1-201ENST00000580374 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.87■■■□□ 2.85
MIR3180-1-201ENST00000580374 IFT140Q96RY7 1462 aa32.85■■■□□ 2.85
MIR3180-1-201ENST00000580374 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.81■■■□□ 2.84
MIR3180-1-201ENST00000580374 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.78■■■□□ 2.84
MIR3180-1-201ENST00000580374 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.69■■■□□ 2.82
MIR3180-1-201ENST00000580374 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.66■■■□□ 2.82
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MIR3180-1-201ENST00000580374 CUX1P39880 1505 aa32.57■■■□□ 2.8
MIR3180-1-201ENST00000580374 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.54■■■□□ 2.8
MIR3180-1-201ENST00000580374 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.54■■■□□ 2.8
MIR3180-1-201ENST00000580374 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.49■■■□□ 2.79
MIR3180-1-201ENST00000580374 SOGA1O94964 1423 aa32.47■■■□□ 2.79
MIR3180-1-201ENST00000580374 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.37■■■□□ 2.77
MIR3180-1-201ENST00000580374 CHD1O14646 1710 aa32.33■■■□□ 2.77
MIR3180-1-201ENST00000580374 WDR97A6NE52 1622 aa32.33■■■□□ 2.77
MIR3180-1-201ENST00000580374 TRIM41Q8WV44 630 aa32.27■■■□□ 2.76
MIR3180-1-201ENST00000580374 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.2■■■□□ 2.75
MIR3180-1-201ENST00000580374 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.2■■■□□ 2.75
MIR3180-1-201ENST00000580374 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.2■■■□□ 2.75
MIR3180-1-201ENST00000580374 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.19■■■□□ 2.74
MIR3180-1-201ENST00000580374 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.17■■■□□ 2.74
MIR3180-1-201ENST00000580374 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.15■■■□□ 2.74
MIR3180-1-201ENST00000580374 GRIN2BQ13224 1484 aa32.15■■■□□ 2.74
MIR3180-1-201ENST00000580374 TOP2BQ02880 1626 aa32.14■■■□□ 2.74
MIR3180-1-201ENST00000580374 SYNJ1O43426 1573 aa32.13■■■□□ 2.73
MIR3180-1-201ENST00000580374 ARHGEF11O15085 1522 aa32.12■■■□□ 2.73
MIR3180-1-201ENST00000580374 FBLN2P98095 1184 aa32.12■■■□□ 2.73
MIR3180-1-201ENST00000580374 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.11■■■□□ 2.73
MIR3180-1-201ENST00000580374 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.11■■■□□ 2.73
MIR3180-1-201ENST00000580374 PBRM1Q86U86 1689 aa32.1■■■□□ 2.73
MIR3180-1-201ENST00000580374 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.1■■■□□ 2.73
MIR3180-1-201ENST00000580374 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.1■■■□□ 2.73
MIR3180-1-201ENST00000580374 SYNJ2O15056 1496 aa32■■■□□ 2.71
MIR3180-1-201ENST00000580374 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.98■■■□□ 2.71
MIR3180-1-201ENST00000580374 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.97■■■□□ 2.71
MIR3180-1-201ENST00000580374 ARAP1Q96P48 1450 aa31.85■■■□□ 2.69
MIR3180-1-201ENST00000580374 ADAMTS12P58397 1594 aa31.81■■■□□ 2.68
MIR3180-1-201ENST00000580374 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.8■■■□□ 2.68
MIR3180-1-201ENST00000580374 GRIN2AQ12879 1464 aa31.76■■■□□ 2.67
MIR3180-1-201ENST00000580374 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.75■■■□□ 2.67
MIR3180-1-201ENST00000580374 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.71■■■□□ 2.67
MIR3180-1-201ENST00000580374 NUP160Q12769 1436 aa31.67■■■□□ 2.66
MIR3180-1-201ENST00000580374 CEP170Q5SW79 1584 aa31.66■■■□□ 2.66
MIR3180-1-201ENST00000580374 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.53■■■□□ 2.64
MIR3180-1-201ENST00000580374 SHROOM2Q13796 1616 aa31.51■■■□□ 2.63
MIR3180-1-201ENST00000580374 IGF1RP08069 1367 aa31.47■■■□□ 2.63
MIR3180-1-201ENST00000580374 KIF27Q86VH2 1401 aa31.45■■■□□ 2.63
MIR3180-1-201ENST00000580374 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.35■■■□□ 2.61
MIR3180-1-201ENST00000580374 CUL7Q14999 1698 aa31.35■■■□□ 2.61
MIR3180-1-201ENST00000580374 JPH4Q96JJ6 628 aa31.3■■■□□ 2.6
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