Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNTG1Q9NSN8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SNTG1Q9NSN8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms