Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD53Q8N9V6 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD53Q8N9V6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms