RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429578.5

LINC00887-203, long intergenic non-protein coding RNA 887, humanhuman

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Gene LINC00887, Length 1,717 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00887-203ENST00000429578 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.07■■■■■ 4.01
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LINC00887-203ENST00000429578 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.08■■■□□ 2.89
LINC00887-203ENST00000429578 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.05■■■□□ 2.88
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LINC00887-203ENST00000429578 SCRIBQ14160 1630 aa32.29■■■□□ 2.76
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LINC00887-203ENST00000429578 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.29■■■□□ 2.6
LINC00887-203ENST00000429578 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.17■■■□□ 2.58
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LINC00887-203ENST00000429578 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.65■■■□□ 2.5
LINC00887-203ENST00000429578 SMARCA2P51531 1590 aa30.58■■■□□ 2.49
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LINC00887-203ENST00000429578 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
LINC00887-203ENST00000429578 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.95■■■□□ 2.39
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LINC00887-203ENST00000429578 NESP48681 1621 aa29.82■■■□□ 2.36
LINC00887-203ENST00000429578 CUX2O14529 1486 aa29.73■■■□□ 2.35
LINC00887-203ENST00000429578 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.66■■■□□ 2.34
LINC00887-203ENST00000429578 CFTRP13569 1480 aa29.57■■■□□ 2.32
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LINC00887-203ENST00000429578 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.56■■■□□ 2.32
LINC00887-203ENST00000429578 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.5■■■□□ 2.31
LINC00887-203ENST00000429578 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
LINC00887-203ENST00000429578 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.44■■■□□ 2.3
LINC00887-203ENST00000429578 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.39■■■□□ 2.3
LINC00887-203ENST00000429578 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.24■■■□□ 2.27
LINC00887-203ENST00000429578 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.22■■■□□ 2.27
LINC00887-203ENST00000429578 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.17■■■□□ 2.26
LINC00887-203ENST00000429578 ABCC8Q09428 1581 aa29.13■■■□□ 2.25
LINC00887-203ENST00000429578 WDR62O43379 1518 aa29.12■■■□□ 2.25
LINC00887-203ENST00000429578 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.02■■■□□ 2.24
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LINC00887-203ENST00000429578 IFT140Q96RY7 1462 aa28.57■■■□□ 2.16
LINC00887-203ENST00000429578 SOGA1O94964 1423 aa28.55■■■□□ 2.16
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LINC00887-203ENST00000429578 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
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LINC00887-203ENST00000429578 KIF27Q86VH2 1401 aa28.35■■■□□ 2.13
LINC00887-203ENST00000429578 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.35■■■□□ 2.13
LINC00887-203ENST00000429578 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.34■■■□□ 2.13
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LINC00887-203ENST00000429578 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.28■■■□□ 2.12
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LINC00887-203ENST00000429578 CHD1O14646 1710 aa28.06■■■□□ 2.08
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LINC00887-203ENST00000429578 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.01■■■□□ 2.07
LINC00887-203ENST00000429578 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.01■■■□□ 2.07
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LINC00887-203ENST00000429578 PRXQ9BXM0 1461 aa28■■■□□ 2.07
LINC00887-203ENST00000429578 ADAMTS12P58397 1594 aa28■■■□□ 2.07
LINC00887-203ENST00000429578 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
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LINC00887-203ENST00000429578 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.93■■■□□ 2.06
LINC00887-203ENST00000429578 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.91■■■□□ 2.06
LINC00887-203ENST00000429578 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
LINC00887-203ENST00000429578 SYNJ2O15056 1496 aa27.87■■■□□ 2.05
LINC00887-203ENST00000429578 GOLGA3Q08378 1498 aa27.87■■■□□ 2.05
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