RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.24■■■■■ 4.35
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HOXC6-201ENST00000243108 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.66■■■■□ 3.3
HOXC6-201ENST00000243108 NACADO15069 1562 aa35.52■■■■□ 3.28
HOXC6-201ENST00000243108 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.43■■■■□ 3.26
HOXC6-201ENST00000243108 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.16■■■■□ 3.22
HOXC6-201ENST00000243108 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.1■■■■□ 3.21
HOXC6-201ENST00000243108 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35■■■■□ 3.19
HOXC6-201ENST00000243108 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.88■■■■□ 3.17
HOXC6-201ENST00000243108 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.83■■■■□ 3.17
HOXC6-201ENST00000243108 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.72■■■■□ 3.15
HOXC6-201ENST00000243108 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.72■■■■□ 3.15
HOXC6-201ENST00000243108 SCRIBQ14160 1630 aa34.42■■■■□ 3.1
HOXC6-201ENST00000243108 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.13■■■■□ 3.05
HOXC6-201ENST00000243108 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.77■■■■□ 3
HOXC6-201ENST00000243108 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.75■■■□□ 2.99
HOXC6-201ENST00000243108 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.55■■■□□ 2.96
HOXC6-201ENST00000243108 SMARCA4P51532 1647 aa32.87■■■□□ 2.85
HOXC6-201ENST00000243108 NCAPD3P42695 1498 aa32.8■■■□□ 2.84
HOXC6-201ENST00000243108 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.79■■■□□ 2.84
HOXC6-201ENST00000243108 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.72■■■□□ 2.83
HOXC6-201ENST00000243108 SMARCA2P51531 1590 aa32.67■■■□□ 2.82
HOXC6-201ENST00000243108 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.59■■■□□ 2.81
HOXC6-201ENST00000243108 HMGXB3Q12766 1538 aa32.59■■■□□ 2.81
HOXC6-201ENST00000243108 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.54■■■□□ 2.8
HOXC6-201ENST00000243108 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.46■■■□□ 2.79
HOXC6-201ENST00000243108 WIZO95785 1651 aa32.24■■■□□ 2.75
HOXC6-201ENST00000243108 NESP48681 1621 aa32.23■■■□□ 2.75
HOXC6-201ENST00000243108 ERCC6Q03468 1493 aa32.12■■■□□ 2.73
HOXC6-201ENST00000243108 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.04■■■□□ 2.72
HOXC6-201ENST00000243108 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.99■■■□□ 2.71
HOXC6-201ENST00000243108 CUX2O14529 1486 aa31.93■■■□□ 2.7
HOXC6-201ENST00000243108 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.83■■■□□ 2.69
HOXC6-201ENST00000243108 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.82■■■□□ 2.68
HOXC6-201ENST00000243108 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
HOXC6-201ENST00000243108 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.79■■■□□ 2.68
HOXC6-201ENST00000243108 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.75■■■□□ 2.67
HOXC6-201ENST00000243108 CFTRP13569 1480 aa31.56■■■□□ 2.64
HOXC6-201ENST00000243108 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.49■■■□□ 2.63
HOXC6-201ENST00000243108 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.47■■■□□ 2.63
HOXC6-201ENST00000243108 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.47■■■□□ 2.63
HOXC6-201ENST00000243108 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.46■■■□□ 2.63
HOXC6-201ENST00000243108 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.43■■■□□ 2.62
HOXC6-201ENST00000243108 WDR62O43379 1518 aa31.42■■■□□ 2.62
HOXC6-201ENST00000243108 PRDM2Q13029 1718 aa31.31■■■□□ 2.6
HOXC6-201ENST00000243108 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.23■■■□□ 2.59
HOXC6-201ENST00000243108 TOPBP1Q92547 1522 aa30.94■■■□□ 2.54
HOXC6-201ENST00000243108 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
HOXC6-201ENST00000243108 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.84■■■□□ 2.53
HOXC6-201ENST00000243108 ABCC8Q09428 1581 aa30.81■■■□□ 2.52
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.79■■■□□ 2.52
HOXC6-201ENST00000243108 IFT140Q96RY7 1462 aa30.78■■■□□ 2.52
HOXC6-201ENST00000243108 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
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HOXC6-201ENST00000243108 CUX1P39880 1505 aa30.59■■■□□ 2.49
HOXC6-201ENST00000243108 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.56■■■□□ 2.48
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HOXC6-201ENST00000243108 SOGA1O94964 1423 aa30.49■■■□□ 2.47
HOXC6-201ENST00000243108 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
HOXC6-201ENST00000243108 CHD1O14646 1710 aa30.34■■■□□ 2.45
HOXC6-201ENST00000243108 WDR97A6NE52 1622 aa30.32■■■□□ 2.45
HOXC6-201ENST00000243108 TRIM41Q8WV44 630 aa30.25■■■□□ 2.43
HOXC6-201ENST00000243108 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.21■■■□□ 2.43
HOXC6-201ENST00000243108 SYNJ1O43426 1573 aa30.2■■■□□ 2.43
HOXC6-201ENST00000243108 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.2■■■□□ 2.42
HOXC6-201ENST00000243108 FBLN2P98095 1184 aa30.19■■■□□ 2.42
HOXC6-201ENST00000243108 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.18■■■□□ 2.42
HOXC6-201ENST00000243108 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.18■■■□□ 2.42
HOXC6-201ENST00000243108 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.18■■■□□ 2.42
HOXC6-201ENST00000243108 TOP2BQ02880 1626 aa30.18■■■□□ 2.42
HOXC6-201ENST00000243108 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.18■■■□□ 2.42
HOXC6-201ENST00000243108 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.18■■■□□ 2.42
HOXC6-201ENST00000243108 GRIN2BQ13224 1484 aa30.16■■■□□ 2.42
HOXC6-201ENST00000243108 PBRM1Q86U86 1689 aa30.14■■■□□ 2.42
HOXC6-201ENST00000243108 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.13■■■□□ 2.41
HOXC6-201ENST00000243108 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.13■■■□□ 2.41
HOXC6-201ENST00000243108 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
HOXC6-201ENST00000243108 ARHGEF11O15085 1522 aa30.1■■■□□ 2.41
HOXC6-201ENST00000243108 SYNJ2O15056 1496 aa30.02■■■□□ 2.4
HOXC6-201ENST00000243108 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
HOXC6-201ENST00000243108 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.97■■■□□ 2.39
HOXC6-201ENST00000243108 ADAMTS12P58397 1594 aa29.86■■■□□ 2.37
HOXC6-201ENST00000243108 ARAP1Q96P48 1450 aa29.85■■■□□ 2.37
HOXC6-201ENST00000243108 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.83■■■□□ 2.37
HOXC6-201ENST00000243108 GRIN2AQ12879 1464 aa29.81■■■□□ 2.36
HOXC6-201ENST00000243108 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.79■■■□□ 2.36
HOXC6-201ENST00000243108 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.75■■■□□ 2.35
HOXC6-201ENST00000243108 CEP170Q5SW79 1584 aa29.72■■■□□ 2.35
HOXC6-201ENST00000243108 NUP160Q12769 1436 aa29.69■■■□□ 2.34
HOXC6-201ENST00000243108 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.6■■■□□ 2.33
HOXC6-201ENST00000243108 KIF27Q86VH2 1401 aa29.55■■■□□ 2.32
HOXC6-201ENST00000243108 IGF1RP08069 1367 aa29.55■■■□□ 2.32
HOXC6-201ENST00000243108 SHROOM2Q13796 1616 aa29.54■■■□□ 2.32
HOXC6-201ENST00000243108 CUL7Q14999 1698 aa29.44■■■□□ 2.3
HOXC6-201ENST00000243108 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.43■■■□□ 2.3
HOXC6-201ENST00000243108 JPH4Q96JJ6 628 aa29.37■■■□□ 2.29
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