RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366662.8

TTC13-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC13, Length 3,112 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13-202ENST00000366662 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.9■■■■□ 3.34
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TTC13-202ENST00000366662 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.61■■■□□ 2.49
TTC13-202ENST00000366662 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.36■■■□□ 2.45
TTC13-202ENST00000366662 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
TTC13-202ENST00000366662 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
TTC13-202ENST00000366662 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.14■■■□□ 2.26
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TTC13-202ENST00000366662 ABCC9O60706 1549 aa29.02■■■□□ 2.24
TTC13-202ENST00000366662 SCRIBQ14160 1630 aa28.89■■■□□ 2.22
TTC13-202ENST00000366662 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.84■■■□□ 2.21
TTC13-202ENST00000366662 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.42■■■□□ 2.14
TTC13-202ENST00000366662 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
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TTC13-202ENST00000366662 NACADO15069 1562 aa28.26■■■□□ 2.11
TTC13-202ENST00000366662 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.12■■■□□ 2.09
TTC13-202ENST00000366662 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.1■■■□□ 2.09
TTC13-202ENST00000366662 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
TTC13-202ENST00000366662 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.05■■■□□ 2.08
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TTC13-202ENST00000366662 TRIM41Q8WV44 630 aa28.01■■■□□ 2.08
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TTC13-202ENST00000366662 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.58■■■□□ 2
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TTC13-202ENST00000366662 ABCC8Q09428 1581 aa27.27■■□□□ 1.96
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TTC13-202ENST00000366662 SMARCA2P51531 1590 aa27.15■■□□□ 1.94
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TTC13-202ENST00000366662 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
TTC13-202ENST00000366662 SOGA1O94964 1423 aa26.98■■□□□ 1.91
TTC13-202ENST00000366662 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.91■■□□□ 1.9
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TTC13-202ENST00000366662 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
TTC13-202ENST00000366662 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
TTC13-202ENST00000366662 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.75■■□□□ 1.87
TTC13-202ENST00000366662 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
TTC13-202ENST00000366662 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.71■■□□□ 1.87
TTC13-202ENST00000366662 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.66■■□□□ 1.86
TTC13-202ENST00000366662 CEP162Q5TB80 1403 aa26.59■■□□□ 1.85
TTC13-202ENST00000366662 SYNJ1O43426 1573 aa26.57■■□□□ 1.84
TTC13-202ENST00000366662 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
TTC13-202ENST00000366662 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
TTC13-202ENST00000366662 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.45■■□□□ 1.83
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TTC13-202ENST00000366662 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.94■■□□□ 1.74
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TTC13-202ENST00000366662 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.9■■□□□ 1.74
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TTC13-202ENST00000366662 KIF27Q86VH2 1401 aa25.86■■□□□ 1.73
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TTC13-202ENST00000366662 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
TTC13-202ENST00000366662 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.31■■□□□ 1.64
TTC13-202ENST00000366662 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.31■■□□□ 1.64
TTC13-202ENST00000366662 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
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TTC13-202ENST00000366662 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
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