RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000500394.6

CPEB2-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CPEB2-AS1, Length 1,630 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.72■■■■■ 4.11
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CPEB2-AS1-201ENST00000500394 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.59■■■□□ 2.97
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.57■■■□□ 2.96
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CPEB2-AS1-201ENST00000500394 SCRIBQ14160 1630 aa32.95■■■□□ 2.87
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CPEB2-AS1-201ENST00000500394 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.64■■■□□ 2.82
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.8■■■□□ 2.68
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CPEB2-AS1-201ENST00000500394 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.72■■■□□ 2.67
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.51■■■□□ 2.64
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CPEB2-AS1-201ENST00000500394 WIZO95785 1651 aa31.17■■■□□ 2.58
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.12■■■□□ 2.57
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 SMARCA2P51531 1590 aa31.1■■■□□ 2.57
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 NCAPD3P42695 1498 aa31.08■■■□□ 2.57
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CPEB2-AS1-201ENST00000500394 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.47■■■□□ 2.47
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CPEB2-AS1-201ENST00000500394 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.22■■■□□ 2.43
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.14■■■□□ 2.42
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 CFTRP13569 1480 aa30.14■■■□□ 2.42
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.95■■■□□ 2.38
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.92■■■□□ 2.38
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 ERCC6Q03468 1493 aa29.9■■■□□ 2.38
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 PRDM2Q13029 1718 aa29.9■■■□□ 2.38
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.89■■■□□ 2.38
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.77■■■□□ 2.36
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.64■■■□□ 2.34
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CPEB2-AS1-201ENST00000500394 ABCC8Q09428 1581 aa29.56■■■□□ 2.32
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 WDR62O43379 1518 aa29.53■■■□□ 2.32
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 TOPBP1Q92547 1522 aa29.48■■■□□ 2.31
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 CUX1P39880 1505 aa29.47■■■□□ 2.31
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CPEB2-AS1-201ENST00000500394 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.22■■■□□ 2.27
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CPEB2-AS1-201ENST00000500394 IFT140Q96RY7 1462 aa29.1■■■□□ 2.25
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
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CPEB2-AS1-201ENST00000500394 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
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CPEB2-AS1-201ENST00000500394 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.98■■■□□ 2.23
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.96■■■□□ 2.23
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CPEB2-AS1-201ENST00000500394 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.82■■■□□ 2.2
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CPEB2-AS1-201ENST00000500394 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.8■■■□□ 2.2
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 PBRM1Q86U86 1689 aa28.72■■■□□ 2.19
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CPEB2-AS1-201ENST00000500394 ADAMTS12P58397 1594 aa28.51■■■□□ 2.15
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CPEB2-AS1-201ENST00000500394 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
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CPEB2-AS1-201ENST00000500394 OSCARQ8IYS5 282 aa28.3■■■□□ 2.12
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CPEB2-AS1-201ENST00000500394 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.28■■■□□ 2.12
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 CEP170Q5SW79 1584 aa28.26■■■□□ 2.11
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 NUP160Q12769 1436 aa28.21■■■□□ 2.11
CPEB2-AS1-201ENST00000500394 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.15■■■□□ 2.1
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CPEB2-AS1-201ENST00000500394 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.03■■■□□ 2.08
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