Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJW8

CNST, Consortin, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNSTQ6PJW8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNSTQ6PJW8 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms