RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376085.3

LRRC38-201, Transcript of leucine rich repeat containing 38, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC38, Length 2,209 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38-201ENST00000376085 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.22■■■■□ 3.71
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LRRC38-201ENST00000376085 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.75■■■□□ 2.67
LRRC38-201ENST00000376085 ABCC9O60706 1549 aa31.51■■■□□ 2.64
LRRC38-201ENST00000376085 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.36■■■□□ 2.61
LRRC38-201ENST00000376085 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.86■■■□□ 2.53
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LRRC38-201ENST00000376085 SCRIBQ14160 1630 aa30.74■■■□□ 2.51
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LRRC38-201ENST00000376085 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.48■■■□□ 2.47
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LRRC38-201ENST00000376085 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.92■■■□□ 2.38
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LRRC38-201ENST00000376085 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.76■■■□□ 2.35
LRRC38-201ENST00000376085 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.68■■■□□ 2.34
LRRC38-201ENST00000376085 WIZO95785 1651 aa29.44■■■□□ 2.3
LRRC38-201ENST00000376085 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
LRRC38-201ENST00000376085 SMARCA4P51532 1647 aa29.32■■■□□ 2.28
LRRC38-201ENST00000376085 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.25■■■□□ 2.27
LRRC38-201ENST00000376085 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
LRRC38-201ENST00000376085 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.86■■■□□ 2.21
LRRC38-201ENST00000376085 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.83■■■□□ 2.21
LRRC38-201ENST00000376085 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.83■■■□□ 2.21
LRRC38-201ENST00000376085 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
LRRC38-201ENST00000376085 SMARCA2P51531 1590 aa28.77■■■□□ 2.2
LRRC38-201ENST00000376085 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
LRRC38-201ENST00000376085 TRIM41Q8WV44 630 aa28.55■■■□□ 2.16
LRRC38-201ENST00000376085 NCAPD3P42695 1498 aa28.49■■■□□ 2.15
LRRC38-201ENST00000376085 ABCC8Q09428 1581 aa28.38■■■□□ 2.13
LRRC38-201ENST00000376085 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.38■■■□□ 2.13
LRRC38-201ENST00000376085 HMGXB3Q12766 1538 aa28.37■■■□□ 2.13
LRRC38-201ENST00000376085 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.35■■■□□ 2.13
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LRRC38-201ENST00000376085 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.1■■■□□ 2.09
LRRC38-201ENST00000376085 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.1■■■□□ 2.09
LRRC38-201ENST00000376085 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.01■■■□□ 2.07
LRRC38-201ENST00000376085 SYNJ1O43426 1573 aa27.95■■■□□ 2.07
LRRC38-201ENST00000376085 CFTRP13569 1480 aa27.95■■■□□ 2.06
LRRC38-201ENST00000376085 SOGA1O94964 1423 aa27.91■■■□□ 2.06
LRRC38-201ENST00000376085 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.86■■■□□ 2.05
LRRC38-201ENST00000376085 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.85■■■□□ 2.05
LRRC38-201ENST00000376085 NESP48681 1621 aa27.77■■■□□ 2.04
LRRC38-201ENST00000376085 CUX1P39880 1505 aa27.7■■■□□ 2.03
LRRC38-201ENST00000376085 TOP2BQ02880 1626 aa27.67■■■□□ 2.02
LRRC38-201ENST00000376085 PRDM2Q13029 1718 aa27.6■■■□□ 2.01
LRRC38-201ENST00000376085 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.6■■■□□ 2.01
LRRC38-201ENST00000376085 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.59■■■□□ 2.01
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LRRC38-201ENST00000376085 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.41■■□□□ 1.98
LRRC38-201ENST00000376085 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.35■■□□□ 1.97
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LRRC38-201ENST00000376085 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.24■■□□□ 1.95
LRRC38-201ENST00000376085 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.24■■□□□ 1.95
LRRC38-201ENST00000376085 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.24■■□□□ 1.95
LRRC38-201ENST00000376085 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.23■■□□□ 1.95
LRRC38-201ENST00000376085 CUX2O14529 1486 aa27.23■■□□□ 1.95
LRRC38-201ENST00000376085 KIF27Q86VH2 1401 aa27.22■■□□□ 1.95
LRRC38-201ENST00000376085 CEP162Q5TB80 1403 aa27.2■■□□□ 1.94
LRRC38-201ENST00000376085 KIF21BO75037 1637 aa27.19■■□□□ 1.94
LRRC38-201ENST00000376085 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
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LRRC38-201ENST00000376085 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
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LRRC38-201ENST00000376085 IGF1RP08069 1367 aa27.1■■□□□ 1.93
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LRRC38-201ENST00000376085 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.95■■□□□ 1.9
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LRRC38-201ENST00000376085 WDR97A6NE52 1622 aa26.86■■□□□ 1.89
LRRC38-201ENST00000376085 ERCC6Q03468 1493 aa26.86■■□□□ 1.89
LRRC38-201ENST00000376085 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
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LRRC38-201ENST00000376085 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.77■■□□□ 1.88
LRRC38-201ENST00000376085 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.76■■□□□ 1.87
LRRC38-201ENST00000376085 WDR62O43379 1518 aa26.75■■□□□ 1.87
LRRC38-201ENST00000376085 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
LRRC38-201ENST00000376085 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
LRRC38-201ENST00000376085 ARAP1Q96P48 1450 aa26.67■■□□□ 1.86
LRRC38-201ENST00000376085 VPS8Q8N3P4 1428 aa26.66■■□□□ 1.86
LRRC38-201ENST00000376085 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.63■■□□□ 1.85
LRRC38-201ENST00000376085 CUL7Q14999 1698 aa26.6■■□□□ 1.85
LRRC38-201ENST00000376085 IFT140Q96RY7 1462 aa26.59■■□□□ 1.85
LRRC38-201ENST00000376085 P3H3Q8IVL6 736 aa26.58■■□□□ 1.85
LRRC38-201ENST00000376085 PBRM1Q86U86 1689 aa26.52■■□□□ 1.84
LRRC38-201ENST00000376085 HRCP23327 699 aa26.48■■□□□ 1.83
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