Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PCP4P48539 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
PCP4P48539 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PCP4P48539 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PCP4P48539 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PCP4P48539 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PCP4P48539 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
PCP4P48539 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PCP4P48539 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PCP4P48539 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PCP4P48539 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PCP4P48539 AC017083.4-201ENST00000406334 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PCP4P48539 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PCP4P48539 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PCP4P48539 ARHGEF10-203ENST00000398560 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PCP4P48539 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PCP4P48539 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PCP4P48539 GMFB-201ENST00000358056 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PCP4P48539 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
PCP4P48539 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PCP4P48539 AC087164.2-201ENST00000624514 3130 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
PCP4P48539 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PCP4P48539 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PCP4P48539 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PCP4P48539 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PCP4P48539 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
PCP4P48539 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
PCP4P48539 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
PCP4P48539 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PCP4P48539 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PCP4P48539 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PCP4P48539 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PCP4P48539 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PCP4P48539 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PCP4P48539 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PCP4P48539 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PCP4P48539 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PCP4P48539 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PCP4P48539 ARPP21-213ENST00000428373 3150 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PCP4P48539 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PCP4P48539 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PCP4P48539 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PCP4P48539 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PCP4P48539 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PCP4P48539 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PCP4P48539 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
PCP4P48539 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PCP4P48539 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PCP4P48539 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PCP4P48539 AC021517.1-202ENST00000585897 2111 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PCP4P48539 TP53I11-203ENST00000395648 3381 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PCP4P48539 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PCP4P48539 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PCP4P48539 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PCP4P48539 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PCP4P48539 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PCP4P48539 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PCP4P48539 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PCP4P48539 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PCP4P48539 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PCP4P48539 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PCP4P48539 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PCP4P48539 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PCP4P48539 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PCP4P48539 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PCP4P48539 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
PCP4P48539 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
PCP4P48539 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms