RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324333.14

GLIS3-201, Transcript of GLIS family zinc finger 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GLIS3, Length 6,667 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS3-201ENST00000324333 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.23■■□□□ 1.47
GLIS3-201ENST00000324333 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
GLIS3-201ENST00000324333 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.7■■□□□ 1.22
GLIS3-201ENST00000324333 NISCHQ9Y2I1 1504 aa22.65■■□□□ 1.22
GLIS3-201ENST00000324333 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.6■■□□□ 1.21
GLIS3-201ENST00000324333 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
GLIS3-201ENST00000324333 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
GLIS3-201ENST00000324333 APLP2Q06481 763 aa21.54■■□□□ 1.04
GLIS3-201ENST00000324333 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
GLIS3-201ENST00000324333 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
GLIS3-201ENST00000324333 PCGF6Q9BYE7 350 aa21.37■■□□□ 1.01
GLIS3-201ENST00000324333 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
GLIS3-201ENST00000324333 TRIM41Q8WV44 630 aa21.06■□□□□ 0.96
GLIS3-201ENST00000324333 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
GLIS3-201ENST00000324333 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
GLIS3-201ENST00000324333 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
GLIS3-201ENST00000324333 UBTFP17480 764 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
GLIS3-201ENST00000324333 ERICH6Q7L0X2 663 aa20.79■□□□□ 0.92
GLIS3-201ENST00000324333 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
GLIS3-201ENST00000324333 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
GLIS3-201ENST00000324333 MYT1Q01538 1121 aa20.48■□□□□ 0.87
GLIS3-201ENST00000324333 ITGAEP38570 1179 aa20.45■□□□□ 0.86
GLIS3-201ENST00000324333 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.38■□□□□ 0.85
GLIS3-201ENST00000324333 HRCP23327 699 aa20.37■□□□□ 0.85
GLIS3-201ENST00000324333 NEFLP07196 543 aa20.32■□□□□ 0.84
GLIS3-201ENST00000324333 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
GLIS3-201ENST00000324333 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
GLIS3-201ENST00000324333 POLR3GLQ9BT43 218 aa20.29■□□□□ 0.84
GLIS3-201ENST00000324333 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.28■□□□□ 0.84
GLIS3-201ENST00000324333 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
GLIS3-201ENST00000324333 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
GLIS3-201ENST00000324333 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.17■□□□□ 0.82
GLIS3-201ENST00000324333 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP19.95■□□□□ 0.78
GLIS3-201ENST00000324333 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
GLIS3-201ENST00000324333 ABCC9O60706 1549 aa19.86■□□□□ 0.77
GLIS3-201ENST00000324333 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
GLIS3-201ENST00000324333 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
GLIS3-201ENST00000324333 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
GLIS3-201ENST00000324333 NEUROD1Q13562 356 aa19.69■□□□□ 0.74
GLIS3-201ENST00000324333 TRIM52Q96A61 297 aa19.66■□□□□ 0.74
GLIS3-201ENST00000324333 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa19.6■□□□□ 0.73
GLIS3-201ENST00000324333 FBLN2P98095 1184 aa19.55■□□□□ 0.72
GLIS3-201ENST00000324333 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
GLIS3-201ENST00000324333 ARID3CA6NKF2 412 aa19.52■□□□□ 0.72
GLIS3-201ENST00000324333 BCANQ96GW7 911 aa19.51■□□□□ 0.71
GLIS3-201ENST00000324333 P3H3Q8IVL6 736 aa19.46■□□□□ 0.71
GLIS3-201ENST00000324333 CLSPNQ9HAW4 1339 aa19.45■□□□□ 0.7
GLIS3-201ENST00000324333 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
GLIS3-201ENST00000324333 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
GLIS3-201ENST00000324333 BCL11AQ9H165 835 aa19.32■□□□□ 0.68
GLIS3-201ENST00000324333 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
GLIS3-201ENST00000324333 ANP32CO43423 234 aa19.23■□□□□ 0.67
GLIS3-201ENST00000324333 SLC24A1O60721 1099 aa19.23■□□□□ 0.67
GLIS3-201ENST00000324333 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
GLIS3-201ENST00000324333 SCRIBQ14160 1630 aa19.18■□□□□ 0.66
GLIS3-201ENST00000324333 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP19.14■□□□□ 0.65
GLIS3-201ENST00000324333 PLPPR3Q6T4P5 718 aa19.07■□□□□ 0.64
GLIS3-201ENST00000324333 CSRNP3Q8WYN3 585 aa19.06■□□□□ 0.64
GLIS3-201ENST00000324333 CANXP27824 592 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
GLIS3-201ENST00000324333 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
GLIS3-201ENST00000324333 CHGAP10645 457 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
GLIS3-201ENST00000324333 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
GLIS3-201ENST00000324333 CHIC2Q9UKJ5 165 aa18.87■□□□□ 0.61
GLIS3-201ENST00000324333 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
GLIS3-201ENST00000324333 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
GLIS3-201ENST00000324333 FKBP8Q14318 412 aa18.85■□□□□ 0.61
GLIS3-201ENST00000324333 NEFMP07197 916 aa18.83■□□□□ 0.6
GLIS3-201ENST00000324333 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
GLIS3-201ENST00000324333 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP18.81■□□□□ 0.6
GLIS3-201ENST00000324333 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
GLIS3-201ENST00000324333 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
GLIS3-201ENST00000324333 FAM9BQ8IZU0 186 aa18.78■□□□□ 0.6
GLIS3-201ENST00000324333 STAG3Q9UJ98 1225 aa18.78■□□□□ 0.6
GLIS3-201ENST00000324333 TONSLQ96HA7 1378 aa18.77■□□□□ 0.6
GLIS3-201ENST00000324333 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
GLIS3-201ENST00000324333 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
GLIS3-201ENST00000324333 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
GLIS3-201ENST00000324333 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP18.71■□□□□ 0.59
GLIS3-201ENST00000324333 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa18.69■□□□□ 0.58
GLIS3-201ENST00000324333 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
GLIS3-201ENST00000324333 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa18.66■□□□□ 0.58
GLIS3-201ENST00000324333 NBR1Q14596 966 aa18.63■□□□□ 0.57
GLIS3-201ENST00000324333 PLEKHG5O94827 1062 aa18.6■□□□□ 0.57
GLIS3-201ENST00000324333 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP18.6■□□□□ 0.57
GLIS3-201ENST00000324333 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
GLIS3-201ENST00000324333 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa18.57■□□□□ 0.56
GLIS3-201ENST00000324333 MIER1Q8N108 512 aa18.54■□□□□ 0.56
GLIS3-201ENST00000324333 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa18.54■□□□□ 0.56
GLIS3-201ENST00000324333 MYO15BQ96JP2 1530 aa18.53■□□□□ 0.56
GLIS3-201ENST00000324333 TMC1Q8TDI8 760 aa18.52■□□□□ 0.56
GLIS3-201ENST00000324333 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
GLIS3-201ENST00000324333 MTUS2Q5JR59 1369 aa18.5■□□□□ 0.55
GLIS3-201ENST00000324333 KCNH8Q96L42 1107 aa18.49■□□□□ 0.55
GLIS3-201ENST00000324333 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
GLIS3-201ENST00000324333 ZBTB7CA1YPR0 619 aa18.47■□□□□ 0.55
GLIS3-201ENST00000324333 MRS2Q9HD23 443 aa18.45■□□□□ 0.54
GLIS3-201ENST00000324333 TSPY4P0CV99 314 aa18.44■□□□□ 0.54
GLIS3-201ENST00000324333 TSPY10P0CW01 314 aa18.44■□□□□ 0.54
GLIS3-201ENST00000324333 ARXQ96QS3 562 aa18.44■□□□□ 0.54
GLIS3-201ENST00000324333 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.6 ms