RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340305.9

TMEM201-201, Transcript of transmembrane protein 201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM201, Length 3,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM201-201ENST00000340305 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.1■■□□□ 1.77
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TMEM201-201ENST00000340305 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
TMEM201-201ENST00000340305 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.02■■□□□ 1.28
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TMEM201-201ENST00000340305 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.77■■□□□ 1.24
TMEM201-201ENST00000340305 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.6■■□□□ 1.21
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TMEM201-201ENST00000340305 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
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TMEM201-201ENST00000340305 SCRIBQ14160 1630 aa21.02■□□□□ 0.96
TMEM201-201ENST00000340305 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21■□□□□ 0.95
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TMEM201-201ENST00000340305 CEP162Q5TB80 1403 aa20.51■□□□□ 0.87
TMEM201-201ENST00000340305 WIZO95785 1651 aa20.46■□□□□ 0.87
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TMEM201-201ENST00000340305 APLP2Q06481 763 aa20.44■□□□□ 0.86
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TMEM201-201ENST00000340305 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa19.52■□□□□ 0.72
TMEM201-201ENST00000340305 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP19.46■□□□□ 0.71
TMEM201-201ENST00000340305 ARAP1Q96P48 1450 aa19.43■□□□□ 0.7
TMEM201-201ENST00000340305 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP19.42■□□□□ 0.7
TMEM201-201ENST00000340305 MSH5O43196 834 aa19.41■□□□□ 0.7
TMEM201-201ENST00000340305 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa19.38■□□□□ 0.69
TMEM201-201ENST00000340305 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
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TMEM201-201ENST00000340305 WDR97A6NE52 1622 aa19.34■□□□□ 0.69
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