Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHKBQ9Y259 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHKBQ9Y259 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHKBQ9Y259 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHKBQ9Y259 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHKBQ9Y259 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHKBQ9Y259 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHKBQ9Y259 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHKBQ9Y259 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHKBQ9Y259 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHKBQ9Y259 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHKBQ9Y259 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHKBQ9Y259 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHKBQ9Y259 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHKBQ9Y259 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHKBQ9Y259 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHKBQ9Y259 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHKBQ9Y259 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHKBQ9Y259 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHKBQ9Y259 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHKBQ9Y259 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHKBQ9Y259 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHKBQ9Y259 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHKBQ9Y259 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CHKBQ9Y259 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHKBQ9Y259 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHKBQ9Y259 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHKBQ9Y259 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHKBQ9Y259 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHKBQ9Y259 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHKBQ9Y259 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHKBQ9Y259 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHKBQ9Y259 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHKBQ9Y259 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHKBQ9Y259 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHKBQ9Y259 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CHKBQ9Y259 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHKBQ9Y259 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHKBQ9Y259 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHKBQ9Y259 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHKBQ9Y259 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHKBQ9Y259 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHKBQ9Y259 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHKBQ9Y259 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHKBQ9Y259 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHKBQ9Y259 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHKBQ9Y259 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHKBQ9Y259 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHKBQ9Y259 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHKBQ9Y259 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHKBQ9Y259 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHKBQ9Y259 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHKBQ9Y259 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHKBQ9Y259 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHKBQ9Y259 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHKBQ9Y259 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHKBQ9Y259 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHKBQ9Y259 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHKBQ9Y259 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHKBQ9Y259 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHKBQ9Y259 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHKBQ9Y259 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHKBQ9Y259 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHKBQ9Y259 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHKBQ9Y259 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHKBQ9Y259 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHKBQ9Y259 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHKBQ9Y259 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHKBQ9Y259 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHKBQ9Y259 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHKBQ9Y259 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHKBQ9Y259 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHKBQ9Y259 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHKBQ9Y259 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHKBQ9Y259 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHKBQ9Y259 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHKBQ9Y259 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHKBQ9Y259 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHKBQ9Y259 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHKBQ9Y259 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHKBQ9Y259 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHKBQ9Y259 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHKBQ9Y259 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHKBQ9Y259 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHKBQ9Y259 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHKBQ9Y259 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHKBQ9Y259 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHKBQ9Y259 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms