Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PHTF1Q9UMS5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PHTF1Q9UMS5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHTF1Q9UMS5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHTF1Q9UMS5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHTF1Q9UMS5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHTF1Q9UMS5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHTF1Q9UMS5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHTF1Q9UMS5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHTF1Q9UMS5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHTF1Q9UMS5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PHTF1Q9UMS5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHTF1Q9UMS5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHTF1Q9UMS5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHTF1Q9UMS5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHTF1Q9UMS5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHTF1Q9UMS5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHTF1Q9UMS5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHTF1Q9UMS5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHTF1Q9UMS5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHTF1Q9UMS5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHTF1Q9UMS5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHTF1Q9UMS5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHTF1Q9UMS5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PHTF1Q9UMS5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHTF1Q9UMS5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHTF1Q9UMS5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHTF1Q9UMS5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHTF1Q9UMS5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHTF1Q9UMS5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHTF1Q9UMS5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PHTF1Q9UMS5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHTF1Q9UMS5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PHTF1Q9UMS5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHTF1Q9UMS5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHTF1Q9UMS5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHTF1Q9UMS5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHTF1Q9UMS5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHTF1Q9UMS5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHTF1Q9UMS5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHTF1Q9UMS5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHTF1Q9UMS5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHTF1Q9UMS5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHTF1Q9UMS5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PHTF1Q9UMS5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHTF1Q9UMS5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHTF1Q9UMS5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PHTF1Q9UMS5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHTF1Q9UMS5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHTF1Q9UMS5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PHTF1Q9UMS5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHTF1Q9UMS5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHTF1Q9UMS5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PHTF1Q9UMS5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHTF1Q9UMS5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHTF1Q9UMS5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHTF1Q9UMS5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PHTF1Q9UMS5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHTF1Q9UMS5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHTF1Q9UMS5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHTF1Q9UMS5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHTF1Q9UMS5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHTF1Q9UMS5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHTF1Q9UMS5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PHTF1Q9UMS5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHTF1Q9UMS5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHTF1Q9UMS5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHTF1Q9UMS5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHTF1Q9UMS5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHTF1Q9UMS5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PHTF1Q9UMS5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PHTF1Q9UMS5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PHTF1Q9UMS5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHTF1Q9UMS5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHTF1Q9UMS5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHTF1Q9UMS5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHTF1Q9UMS5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHTF1Q9UMS5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHTF1Q9UMS5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHTF1Q9UMS5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHTF1Q9UMS5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHTF1Q9UMS5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHTF1Q9UMS5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHTF1Q9UMS5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHTF1Q9UMS5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHTF1Q9UMS5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PHTF1Q9UMS5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHTF1Q9UMS5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PHTF1Q9UMS5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHTF1Q9UMS5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHTF1Q9UMS5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHTF1Q9UMS5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHTF1Q9UMS5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHTF1Q9UMS5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PHTF1Q9UMS5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHTF1Q9UMS5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHTF1Q9UMS5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHTF1Q9UMS5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PHTF1Q9UMS5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHTF1Q9UMS5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.5 ms