Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HMG20BQ9P0W2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HMG20BQ9P0W2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HMG20BQ9P0W2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HMG20BQ9P0W2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HMG20BQ9P0W2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HMG20BQ9P0W2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HMG20BQ9P0W2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HMG20BQ9P0W2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HMG20BQ9P0W2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HMG20BQ9P0W2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HMG20BQ9P0W2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HMG20BQ9P0W2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HMG20BQ9P0W2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HMG20BQ9P0W2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HMG20BQ9P0W2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HMG20BQ9P0W2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HMG20BQ9P0W2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HMG20BQ9P0W2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HMG20BQ9P0W2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HMG20BQ9P0W2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HMG20BQ9P0W2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
HMG20BQ9P0W2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HMG20BQ9P0W2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HMG20BQ9P0W2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HMG20BQ9P0W2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HMG20BQ9P0W2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HMG20BQ9P0W2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HMG20BQ9P0W2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HMG20BQ9P0W2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HMG20BQ9P0W2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HMG20BQ9P0W2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HMG20BQ9P0W2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HMG20BQ9P0W2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HMG20BQ9P0W2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HMG20BQ9P0W2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HMG20BQ9P0W2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
HMG20BQ9P0W2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HMG20BQ9P0W2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HMG20BQ9P0W2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HMG20BQ9P0W2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HMG20BQ9P0W2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HMG20BQ9P0W2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HMG20BQ9P0W2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HMG20BQ9P0W2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HMG20BQ9P0W2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HMG20BQ9P0W2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HMG20BQ9P0W2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HMG20BQ9P0W2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HMG20BQ9P0W2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HMG20BQ9P0W2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HMG20BQ9P0W2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HMG20BQ9P0W2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HMG20BQ9P0W2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HMG20BQ9P0W2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HMG20BQ9P0W2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HMG20BQ9P0W2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HMG20BQ9P0W2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HMG20BQ9P0W2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HMG20BQ9P0W2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HMG20BQ9P0W2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HMG20BQ9P0W2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HMG20BQ9P0W2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
HMG20BQ9P0W2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HMG20BQ9P0W2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HMG20BQ9P0W2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HMG20BQ9P0W2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HMG20BQ9P0W2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HMG20BQ9P0W2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HMG20BQ9P0W2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HMG20BQ9P0W2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HMG20BQ9P0W2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HMG20BQ9P0W2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HMG20BQ9P0W2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HMG20BQ9P0W2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HMG20BQ9P0W2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HMG20BQ9P0W2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HMG20BQ9P0W2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HMG20BQ9P0W2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HMG20BQ9P0W2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
HMG20BQ9P0W2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HMG20BQ9P0W2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HMG20BQ9P0W2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HMG20BQ9P0W2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HMG20BQ9P0W2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HMG20BQ9P0W2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
HMG20BQ9P0W2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HMG20BQ9P0W2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HMG20BQ9P0W2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HMG20BQ9P0W2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HMG20BQ9P0W2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HMG20BQ9P0W2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HMG20BQ9P0W2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HMG20BQ9P0W2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HMG20BQ9P0W2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
HMG20BQ9P0W2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HMG20BQ9P0W2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HMG20BQ9P0W2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HMG20BQ9P0W2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HMG20BQ9P0W2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms