Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC3.9□□□□□ -1.782e-24■■■■■ 44.8
DROSHAQ9NRR4 PNCK-216ENST00000458354 498 ntTSL 344.27■■■■■ 4.684e-7■■■■■ 44.8
DROSHAQ9NRR4 PNCK-207ENST00000419804 561 ntTSL 428.64■■■□□ 2.184e-7■■■■■ 44.8
DROSHAQ9NRR4 PNCK-209ENST00000423545 448 ntTSL 428.49■■■□□ 2.154e-7■■■■■ 44.8
DROSHAQ9NRR4 PNCK-231ENST00000488994 1437 ntTSL 228■■■□□ 2.074e-7■■■■■ 44.8
DROSHAQ9NRR4 PNCK-210ENST00000425526 725 ntTSL 524.59■■□□□ 1.534e-7■■■■■ 44.8
DROSHAQ9NRR4 COMT-207ENST00000412786 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 224.67■■□□□ 1.542e-10■■■■■ 44.6
DROSHAQ9NRR4 COMT-201ENST00000207636 1319 ntTSL 523.24■■□□□ 1.312e-10■■■■■ 44.6
DROSHAQ9NRR4 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.312e-10■■■■■ 44.6
DROSHAQ9NRR4 TOLLIP-207ENST00000527886 3666 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.253e-7■■■■■ 44.5
DROSHAQ9NRR4 EHMT1-228ENST00000636027 3114 ntTSL 516.32■□□□□ 0.23e-8■■■■■ 44.4
DROSHAQ9NRR4 EHMT1-249ENST00000637949 575 ntTSL 514.01□□□□□ -0.173e-8■■■■■ 44.4
DROSHAQ9NRR4 WDR82-204ENST00000487402 4333 ntTSL 213.53□□□□□ -0.249e-15■■■■■ 44.4
DROSHAQ9NRR4 NSRP1-208ENST00000580103 774 ntTSL 515.76■□□□□ 0.114e-7■■■■■ 44.3
DROSHAQ9NRR4 NSRP1-203ENST00000467446 548 ntTSL 311.33□□□□□ -0.64e-7■■■■■ 44.3
DROSHAQ9NRR4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.524e-9■■■■■ 44.3
DROSHAQ9NRR4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.394e-9■■■■■ 44.3
DROSHAQ9NRR4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.014e-9■■■■■ 44.3
DROSHAQ9NRR4 NDEL1-203ENST00000402554 1858 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.714e-9■■■■■ 44.3
DROSHAQ9NRR4 NDEL1-211ENST00000581679 582 ntTSL 45.23□□□□□ -1.574e-9■■■■■ 44.3
DROSHAQ9NRR4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.591e-20■■■■■ 44.2
DROSHAQ9NRR4 FTX-207ENST00000602576 574 ntTSL 418.67■□□□□ 0.582e-9■■■■■ 44.1
DROSHAQ9NRR4 FTX-202ENST00000423992 696 ntTSL 516.66■□□□□ 0.262e-9■■■■■ 44.1
DROSHAQ9NRR4 FTX-201ENST00000418855 579 ntTSL 213.81□□□□□ -0.22e-9■■■■■ 44.1
DROSHAQ9NRR4 FTX-203ENST00000429124 2597 ntTSL 211.88□□□□□ -0.512e-9■■■■■ 44.1
DROSHAQ9NRR4 FTX-204ENST00000430772 708 ntTSL 511.44□□□□□ -0.582e-9■■■■■ 44.1
DROSHAQ9NRR4 FTX-208ENST00000602776 561 ntTSL 48.31□□□□□ -1.082e-9■■■■■ 44.1
DROSHAQ9NRR4 FTX-205ENST00000455395 654 ntTSL 38.22□□□□□ -1.092e-9■■■■■ 44.1
DROSHAQ9NRR4 NDEL1-217ENST00000583683 1802 ntTSL 227.64■■■□□ 2.014e-9■■■■■ 44
DROSHAQ9NRR4 SKA2-209ENST00000583976 570 ntTSL 224.76■■□□□ 1.554e-8■■■■■ 44
DROSHAQ9NRR4 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.184e-8■■■■■ 44
DROSHAQ9NRR4 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.074e-8■■■■■ 44
DROSHAQ9NRR4 SKA2-206ENST00000581068 595 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.274e-8■■■■■ 44
DROSHAQ9NRR4 SKA2-204ENST00000578519 894 ntTSL 316.56■□□□□ 0.244e-8■■■■■ 44
DROSHAQ9NRR4 SKA2-208ENST00000583927 533 ntTSL 215.31■□□□□ 0.044e-8■■■■■ 44
DROSHAQ9NRR4 SKA2-203ENST00000578105 689 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.444e-8■■■■■ 44
DROSHAQ9NRR4 SKA2-207ENST00000583380 583 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.454e-8■■■■■ 44
DROSHAQ9NRR4 SKA2-201ENST00000330137 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.584e-8■■■■■ 44
DROSHAQ9NRR4 CCDC88B-205ENST00000472524 779 ntTSL 224.49■■□□□ 1.518e-7■■■■■ 43.9
DROSHAQ9NRR4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.779e-9■■■■■ 43.9
DROSHAQ9NRR4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC30.86■■■□□ 2.539e-9■■■■■ 43.9
DROSHAQ9NRR4 FADS3-205ENST00000526294 550 ntTSL 327.31■■□□□ 1.969e-9■■■■■ 43.9
DROSHAQ9NRR4 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.879e-9■■■■■ 43.9
DROSHAQ9NRR4 SERP1-203ENST00000479209 3934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.289e-9■■■■■ 43.9
DROSHAQ9NRR4 LIG4-202ENST00000405925 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.479e-9■■■■■ 43.9
DROSHAQ9NRR4 LIG4-204ENST00000611712 4180 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.559e-9■■■■■ 43.9
DROSHAQ9NRR4 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.619e-9■■■■■ 43.9
DROSHAQ9NRR4 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.839e-9■■■■■ 43.9
DROSHAQ9NRR4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.482e-7■■■■■ 43.8
DROSHAQ9NRR4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.762e-7■■■■■ 43.8
DROSHAQ9NRR4 PDCD6-203ENST00000505526 1484 ntTSL 1 (best)24.6■■□□□ 1.532e-7■■■■■ 43.8
DROSHAQ9NRR4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.452e-7■■■■■ 43.8
DROSHAQ9NRR4 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.442e-7■■■■■ 43.8
DROSHAQ9NRR4 PDCD6-204ENST00000506909 458 ntTSL 320.85■□□□□ 0.932e-7■■■■■ 43.8
DROSHAQ9NRR4 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.882e-7■■■■■ 43.8
DROSHAQ9NRR4 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.882e-7■■■■■ 43.8
DROSHAQ9NRR4 PDCD6-210ENST00000513582 3500 ntTSL 214.51□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 43.8
DROSHAQ9NRR4 PDCD6-205ENST00000507473 486 ntTSL 311.75□□□□□ -0.532e-7■■■■■ 43.8
DROSHAQ9NRR4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.971e-6■■■■■ 43.7
DROSHAQ9NRR4 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC20.54■□□□□ 0.881e-8■■■■■ 43.7
DROSHAQ9NRR4 AC073869.1-202ENST00000438378 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.011e-8■■■■■ 43.7
DROSHAQ9NRR4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.776e-7■■■■■ 43.6
DROSHAQ9NRR4 MAEA-210ENST00000508634 694 ntTSL 225.78■■□□□ 1.723e-8■■■■■ 43.5
DROSHAQ9NRR4 POFUT2-205ENST00000460932 616 ntTSL 225.27■■□□□ 1.641e-9■■■■■ 43.3
DROSHAQ9NRR4 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.171e-9■■■■■ 43.3
DROSHAQ9NRR4 POFUT2-208ENST00000471540 3176 ntTSL 516.51■□□□□ 0.231e-9■■■■■ 43.3
DROSHAQ9NRR4 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.343e-6■■■■■ 43
DROSHAQ9NRR4 SLC1A2-206ENST00000479543 564 ntTSL 520.46■□□□□ 0.877e-9■■■■■ 43
DROSHAQ9NRR4 SLC1A2-205ENST00000464522 607 ntTSL 38.73□□□□□ -1.017e-9■■■■■ 43
DROSHAQ9NRR4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.693e-10■■■■■ 42.9
DROSHAQ9NRR4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.083e-7■■■■■ 42.9
DROSHAQ9NRR4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.933e-10■■■■■ 42.9
DROSHAQ9NRR4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.643e-10■■■■■ 42.9
DROSHAQ9NRR4 MAD1L1-205ENST00000421113 564 ntTSL 430.87■■■□□ 2.532e-6■■■■■ 42.9
DROSHAQ9NRR4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.323e-10■■■■■ 42.9
DROSHAQ9NRR4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.933e-7■■■■■ 42.9
DROSHAQ9NRR4 TGIF1-221ENST00000552383 1267 ntTSL 226■■□□□ 1.753e-10■■■■■ 42.9
DROSHAQ9NRR4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.63e-10■■■■■ 42.9
DROSHAQ9NRR4 MAD1L1-215ENST00000464742 449 ntTSL 524.91■■□□□ 1.583e-10■■■■■ 42.9
DROSHAQ9NRR4 MAD1L1-210ENST00000444373 535 ntTSL 423.94■■□□□ 1.422e-6■■■■■ 42.9
DROSHAQ9NRR4 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.153e-10■■■■■ 42.9
DROSHAQ9NRR4 TGIF1-209ENST00000546979 554 ntTSL 321.21■□□□□ 0.993e-10■■■■■ 42.9
DROSHAQ9NRR4 MAD1L1-209ENST00000438959 839 ntTSL 321.18■□□□□ 0.982e-6■■■■■ 42.9
DROSHAQ9NRR4 MAD1L1-222ENST00000491858 494 ntTSL 420.4■□□□□ 0.863e-10■■■■■ 42.9
DROSHAQ9NRR4 TGIF1-216ENST00000550958 706 ntTSL 314.13□□□□□ -0.153e-10■■■■■ 42.9
DROSHAQ9NRR4 TGIF1-223ENST00000618001 3030 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.363e-10■■■■■ 42.9
DROSHAQ9NRR4 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.813e-10■■■■■ 42.9
DROSHAQ9NRR4 TGIF1-215ENST00000549780 801 ntTSL 58.65□□□□□ -1.023e-10■■■■■ 42.9
DROSHAQ9NRR4 TGIF1-212ENST00000549253 563 ntTSL 37.91□□□□□ -1.143e-10■■■■■ 42.9
DROSHAQ9NRR4 MEF2A-208ENST00000558856 574 ntTSL 439.23■■■■□ 3.871e-6■■■■■ 42.8
DROSHAQ9NRR4 MEF2A-210ENST00000559036 685 ntTSL 239.23■■■■□ 3.871e-6■■■■■ 42.8
DROSHAQ9NRR4 MEF2A-209ENST00000558983 847 ntTSL 339.17■■■■□ 3.861e-6■■■■■ 42.8
DROSHAQ9NRR4 MEF2A-212ENST00000560493 732 ntTSL 436.59■■■■□ 3.451e-6■■■■■ 42.8
DROSHAQ9NRR4 MEF2A-211ENST00000559903 574 ntTSL 333.46■■■□□ 2.951e-6■■■■■ 42.8
DROSHAQ9NRR4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.661e-6■■■■■ 42.8
DROSHAQ9NRR4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.421e-6■■■■■ 42.8
DROSHAQ9NRR4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.331e-6■■■■■ 42.8
DROSHAQ9NRR4 MEF2A-206ENST00000558049 565 ntTSL 421.65■■□□□ 1.061e-6■■■■■ 42.8
DROSHAQ9NRR4 MEF2A-203ENST00000449277 5182 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.441e-6■■■■■ 42.8
DROSHAQ9NRR4 MEF2A-205ENST00000557942 5413 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.561e-6■■■■■ 42.8
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