RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458354.5

PNCK-216, Transcript of pregnancy up-regulated nonubiquitous CaM kinase, humanhuman

TSL 3

Gene PNCK, Length 498 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNCK-216ENST00000458354 NISCHQ9Y2I1 1504 aa71.07■■■■■ 8.97
PNCK-216ENST00000458354 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa63.52■■■■■ 7.76
PNCK-216ENST00000458354 ABCC9O60706 1549 aa62.79■■■■■ 7.64
PNCK-216ENST00000458354 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa60.14■■■■■ 7.22
PNCK-216ENST00000458354 NACADO15069 1562 aa59.88■■■■■ 7.18
PNCK-216ENST00000458354 DCAF8L2P0C7V8 631 aa59.77■■■■■ 7.16
PNCK-216ENST00000458354 MYO15BQ96JP2 1530 aa59.27■■■■■ 7.08
PNCK-216ENST00000458354 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP59.05■■■■■ 7.04
PNCK-216ENST00000458354 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa58.77■■■■■ 7
PNCK-216ENST00000458354 UNC13AQ9UPW8 1703 aa58.7■■■■■ 6.99
PNCK-216ENST00000458354 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP58.55■■■■■ 6.96
PNCK-216ENST00000458354 BICRAQ9NZM4 1560 aa58.25■■■■■ 6.91
PNCK-216ENST00000458354 DNAJC5BQ9UF47 199 aa58.15■■■■■ 6.9
PNCK-216ENST00000458354 SCRIBQ14160 1630 aa57.9■■■■■ 6.86
PNCK-216ENST00000458354 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa57.65■■■■■ 6.82
PNCK-216ENST00000458354 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP56.81■■■■■ 6.69
PNCK-216ENST00000458354 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa56.75■■■■■ 6.68
PNCK-216ENST00000458354 CECR2Q9BXF3 1484 aa56.5■■■■■ 6.63
PNCK-216ENST00000458354 SMARCA4P51532 1647 aa55.31■■■■■ 6.44
PNCK-216ENST00000458354 NCAPD3P42695 1498 aa55.24■■■■■ 6.43
PNCK-216ENST00000458354 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP55.17■■■■■ 6.42
PNCK-216ENST00000458354 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa55.16■■■■■ 6.42
PNCK-216ENST00000458354 SMARCA2P51531 1590 aa55.11■■■■■ 6.41
PNCK-216ENST00000458354 HMGXB3Q12766 1538 aa54.91■■■■■ 6.38
PNCK-216ENST00000458354 PEG3Q9GZU2 1588 aa54.75■■■■■ 6.35
PNCK-216ENST00000458354 MROH2BQ7Z745 1585 aa54.74■■■■■ 6.35
PNCK-216ENST00000458354 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP54.72■■■■■ 6.35
PNCK-216ENST00000458354 ERCC6Q03468 1493 aa54.23■■■■■ 6.27
PNCK-216ENST00000458354 WIZO95785 1651 aa54.14■■■■■ 6.26
PNCK-216ENST00000458354 NESP48681 1621 aa54.09■■■■■ 6.25
PNCK-216ENST00000458354 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa53.92■■■■■ 6.22
PNCK-216ENST00000458354 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP53.87■■■■■ 6.21
PNCK-216ENST00000458354 CUX2O14529 1486 aa53.85■■■■■ 6.21
PNCK-216ENST00000458354 CADPSQ9ULU8 1353 aa53.61■■■■■ 6.17
PNCK-216ENST00000458354 PDS5BQ9NTI5 1447 aa53.6■■■■■ 6.17
PNCK-216ENST00000458354 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP53.54■■■■■ 6.16
PNCK-216ENST00000458354 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa53.47■■■■■ 6.15
PNCK-216ENST00000458354 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP53.43■■■■■ 6.14
PNCK-216ENST00000458354 CFTRP13569 1480 aa53.13■■■■■ 6.1
PNCK-216ENST00000458354 MRC2Q9UBG0 1479 aa53.07■■■■■ 6.09
PNCK-216ENST00000458354 CEP164Q9UPV0 1460 aa53.02■■■■■ 6.08
PNCK-216ENST00000458354 FANCD2Q9BXW9 1451 aa53■■■■■ 6.07
PNCK-216ENST00000458354 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa52.97■■■■■ 6.07
PNCK-216ENST00000458354 CCDC88BA6NC98 1476 aa52.9■■■■■ 6.06
PNCK-216ENST00000458354 WDR62O43379 1518 aa52.89■■■■■ 6.06
PNCK-216ENST00000458354 PRDM2Q13029 1718 aa52.71■■■■■ 6.03
PNCK-216ENST00000458354 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP52.47■■■■■ 5.99
PNCK-216ENST00000458354 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP52.1■■■■■ 5.93
PNCK-216ENST00000458354 ABCC8Q09428 1581 aa52.08■■■■■ 5.93
PNCK-216ENST00000458354 TOPBP1Q92547 1522 aa52.06■■■■■ 5.92
PNCK-216ENST00000458354 DNMBPQ6XZF7 1577 aa51.96■■■■■ 5.91
PNCK-216ENST00000458354 IFT140Q96RY7 1462 aa51.93■■■■■ 5.9
PNCK-216ENST00000458354 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP51.69■■■■■ 5.87
PNCK-216ENST00000458354 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP51.57■■■■■ 5.85
PNCK-216ENST00000458354 OSCARQ8IYS5 282 aa51.54■■■■■ 5.84
PNCK-216ENST00000458354 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP51.53■■■■■ 5.84
PNCK-216ENST00000458354 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP51.5■■■■■ 5.84
PNCK-216ENST00000458354 CUX1P39880 1505 aa51.4■■■■■ 5.82
PNCK-216ENST00000458354 SOGA1O94964 1423 aa51.38■■■■■ 5.82
PNCK-216ENST00000458354 FGD5Q6ZNL6 1462 aa51.36■■■■■ 5.81
PNCK-216ENST00000458354 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa51.35■■■■■ 5.81
PNCK-216ENST00000458354 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP51.35■■■■■ 5.816e-8■■■■■ 29.2
PNCK-216ENST00000458354 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP51.16■■■■■ 5.78
PNCK-216ENST00000458354 WDR97A6NE52 1622 aa51.13■■■■■ 5.78
PNCK-216ENST00000458354 TRIM41Q8WV44 630 aa51■■■■■ 5.75
PNCK-216ENST00000458354 CHD1O14646 1710 aa50.99■■■■■ 5.75
PNCK-216ENST00000458354 FBLN2P98095 1184 aa50.96■■■■■ 5.75
PNCK-216ENST00000458354 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP50.87■■■■■ 5.73
PNCK-216ENST00000458354 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa50.87■■■■■ 5.73
PNCK-216ENST00000458354 GRIN2BQ13224 1484 aa50.86■■■■■ 5.73
PNCK-216ENST00000458354 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa50.82■■■■■ 5.73
PNCK-216ENST00000458354 TOP2BQ02880 1626 aa50.81■■■■■ 5.72
PNCK-216ENST00000458354 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa50.81■■■■■ 5.72
PNCK-216ENST00000458354 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP50.8■■■■■ 5.72
PNCK-216ENST00000458354 GAPVD1Q14C86 1478 aa50.78■■■■■ 5.72
PNCK-216ENST00000458354 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa50.74■■■■■ 5.71
PNCK-216ENST00000458354 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa50.74■■■■■ 5.71
PNCK-216ENST00000458354 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa50.74■■■■■ 5.71
PNCK-216ENST00000458354 SYNJ1O43426 1573 aa50.74■■■■■ 5.71
PNCK-216ENST00000458354 PBRM1Q86U86 1689 aa50.72■■■■■ 5.71
PNCK-216ENST00000458354 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP50.7■■■■■ 5.71
PNCK-216ENST00000458354 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa50.67■■■■■ 5.7
PNCK-216ENST00000458354 ARHGEF11O15085 1522 aa50.66■■■■■ 5.7
PNCK-216ENST00000458354 SYNJ2O15056 1496 aa50.6■■■■■ 5.69
PNCK-216ENST00000458354 CLASP1Q7Z460 1538 aa50.39■■■■■ 5.66
PNCK-216ENST00000458354 CYB5RLQ6IPT4 315 aa50.27■■■■■ 5.64
PNCK-216ENST00000458354 ADAMTS12P58397 1594 aa50.25■■■■■ 5.63
PNCK-216ENST00000458354 ERICH3Q5RHP9 1530 aa50.22■■■■■ 5.63
PNCK-216ENST00000458354 GRIN2AQ12879 1464 aa50.2■■■■■ 5.63
PNCK-216ENST00000458354 ARAP1Q96P48 1450 aa50.18■■■■■ 5.62
PNCK-216ENST00000458354 FHAD1B1AJZ9 1412 aa50.17■■■■■ 5.62
PNCK-216ENST00000458354 NUP160Q12769 1436 aa49.97■■■■■ 5.59
PNCK-216ENST00000458354 CEP170Q5SW79 1584 aa49.95■■■■■ 5.59
PNCK-216ENST00000458354 KIF27Q86VH2 1401 aa49.89■■■■■ 5.58
PNCK-216ENST00000458354 IGF1RP08069 1367 aa49.7■■■■■ 5.55
PNCK-216ENST00000458354 SHROOM2Q13796 1616 aa49.67■■■■■ 5.54
PNCK-216ENST00000458354 CUL7Q14999 1698 aa49.66■■■■■ 5.54
PNCK-216ENST00000458354 ERCC6L2Q5T890 1561 aa49.62■■■■■ 5.53
PNCK-216ENST00000458354 TRHP20396 242 aaPredicted RBP49.54■■■■■ 5.52
PNCK-216ENST00000458354 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa49.52■■■■■ 5.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms