RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458354.5

PNCK-216, Transcript of pregnancy up-regulated nonubiquitous CaM kinase, humanhuman

TSL 3

Gene PNCK, Length 498 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNCK-216ENST00000458354 NISCHQ9Y2I1 1504 aa71.07■■■■■ 8.97
PNCK-216ENST00000458354 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa63.52■■■■■ 7.76
PNCK-216ENST00000458354 ABCC9O60706 1549 aa62.79■■■■■ 7.64
PNCK-216ENST00000458354 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa60.14■■■■■ 7.22
PNCK-216ENST00000458354 NACADO15069 1562 aa59.88■■■■■ 7.18
PNCK-216ENST00000458354 DCAF8L2P0C7V8 631 aa59.77■■■■■ 7.16
PNCK-216ENST00000458354 MYO15BQ96JP2 1530 aa59.27■■■■■ 7.08
PNCK-216ENST00000458354 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP59.05■■■■■ 7.04
PNCK-216ENST00000458354 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa58.77■■■■■ 7
PNCK-216ENST00000458354 UNC13AQ9UPW8 1703 aa58.7■■■■■ 6.99
PNCK-216ENST00000458354 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP58.55■■■■■ 6.96
PNCK-216ENST00000458354 BICRAQ9NZM4 1560 aa58.25■■■■■ 6.91
PNCK-216ENST00000458354 DNAJC5BQ9UF47 199 aa58.15■■■■■ 6.9
PNCK-216ENST00000458354 SCRIBQ14160 1630 aa57.9■■■■■ 6.86
PNCK-216ENST00000458354 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa57.65■■■■■ 6.82
PNCK-216ENST00000458354 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP56.81■■■■■ 6.69
PNCK-216ENST00000458354 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa56.75■■■■■ 6.68
PNCK-216ENST00000458354 CECR2Q9BXF3 1484 aa56.5■■■■■ 6.63
PNCK-216ENST00000458354 SMARCA4P51532 1647 aa55.31■■■■■ 6.44
PNCK-216ENST00000458354 NCAPD3P42695 1498 aa55.24■■■■■ 6.43
PNCK-216ENST00000458354 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP55.17■■■■■ 6.42
PNCK-216ENST00000458354 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa55.16■■■■■ 6.42
PNCK-216ENST00000458354 SMARCA2P51531 1590 aa55.11■■■■■ 6.41
PNCK-216ENST00000458354 HMGXB3Q12766 1538 aa54.91■■■■■ 6.38
PNCK-216ENST00000458354 PEG3Q9GZU2 1588 aa54.75■■■■■ 6.35
PNCK-216ENST00000458354 MROH2BQ7Z745 1585 aa54.74■■■■■ 6.35
PNCK-216ENST00000458354 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP54.72■■■■■ 6.35
PNCK-216ENST00000458354 ERCC6Q03468 1493 aa54.23■■■■■ 6.27
PNCK-216ENST00000458354 WIZO95785 1651 aa54.14■■■■■ 6.26
PNCK-216ENST00000458354 NESP48681 1621 aa54.09■■■■■ 6.25
PNCK-216ENST00000458354 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa53.92■■■■■ 6.22
PNCK-216ENST00000458354 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP53.87■■■■■ 6.21
PNCK-216ENST00000458354 CUX2O14529 1486 aa53.85■■■■■ 6.21
PNCK-216ENST00000458354 CADPSQ9ULU8 1353 aa53.61■■■■■ 6.17
PNCK-216ENST00000458354 PDS5BQ9NTI5 1447 aa53.6■■■■■ 6.17
PNCK-216ENST00000458354 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP53.54■■■■■ 6.16
PNCK-216ENST00000458354 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa53.47■■■■■ 6.15
PNCK-216ENST00000458354 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP53.43■■■■■ 6.14
PNCK-216ENST00000458354 CFTRP13569 1480 aa53.13■■■■■ 6.1
PNCK-216ENST00000458354 MRC2Q9UBG0 1479 aa53.07■■■■■ 6.09
PNCK-216ENST00000458354 CEP164Q9UPV0 1460 aa53.02■■■■■ 6.08
PNCK-216ENST00000458354 FANCD2Q9BXW9 1451 aa53■■■■■ 6.07
PNCK-216ENST00000458354 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa52.97■■■■■ 6.07
PNCK-216ENST00000458354 CCDC88BA6NC98 1476 aa52.9■■■■■ 6.06
PNCK-216ENST00000458354 WDR62O43379 1518 aa52.89■■■■■ 6.06
PNCK-216ENST00000458354 PRDM2Q13029 1718 aa52.71■■■■■ 6.03
PNCK-216ENST00000458354 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP52.47■■■■■ 5.99
PNCK-216ENST00000458354 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP52.1■■■■■ 5.93
PNCK-216ENST00000458354 ABCC8Q09428 1581 aa52.08■■■■■ 5.93
PNCK-216ENST00000458354 TOPBP1Q92547 1522 aa52.06■■■■■ 5.92
PNCK-216ENST00000458354 DNMBPQ6XZF7 1577 aa51.96■■■■■ 5.91
PNCK-216ENST00000458354 IFT140Q96RY7 1462 aa51.93■■■■■ 5.9
PNCK-216ENST00000458354 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP51.69■■■■■ 5.87
PNCK-216ENST00000458354 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP51.57■■■■■ 5.85
PNCK-216ENST00000458354 OSCARQ8IYS5 282 aa51.54■■■■■ 5.84
PNCK-216ENST00000458354 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP51.53■■■■■ 5.84
PNCK-216ENST00000458354 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP51.5■■■■■ 5.84
PNCK-216ENST00000458354 CUX1P39880 1505 aa51.4■■■■■ 5.82
PNCK-216ENST00000458354 SOGA1O94964 1423 aa51.38■■■■■ 5.82
PNCK-216ENST00000458354 FGD5Q6ZNL6 1462 aa51.36■■■■■ 5.81
PNCK-216ENST00000458354 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa51.35■■■■■ 5.81
PNCK-216ENST00000458354 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP51.35■■■■■ 5.816e-8■■■■■ 29.2
PNCK-216ENST00000458354 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP51.16■■■■■ 5.78
PNCK-216ENST00000458354 WDR97A6NE52 1622 aa51.13■■■■■ 5.78
PNCK-216ENST00000458354 TRIM41Q8WV44 630 aa51■■■■■ 5.75
PNCK-216ENST00000458354 CHD1O14646 1710 aa50.99■■■■■ 5.75
PNCK-216ENST00000458354 FBLN2P98095 1184 aa50.96■■■■■ 5.75
PNCK-216ENST00000458354 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP50.87■■■■■ 5.73
PNCK-216ENST00000458354 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa50.87■■■■■ 5.73
PNCK-216ENST00000458354 GRIN2BQ13224 1484 aa50.86■■■■■ 5.73
PNCK-216ENST00000458354 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa50.82■■■■■ 5.73
PNCK-216ENST00000458354 TOP2BQ02880 1626 aa50.81■■■■■ 5.72
PNCK-216ENST00000458354 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa50.81■■■■■ 5.72
PNCK-216ENST00000458354 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP50.8■■■■■ 5.72
PNCK-216ENST00000458354 GAPVD1Q14C86 1478 aa50.78■■■■■ 5.72
PNCK-216ENST00000458354 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa50.74■■■■■ 5.71
PNCK-216ENST00000458354 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa50.74■■■■■ 5.71
PNCK-216ENST00000458354 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa50.74■■■■■ 5.71
PNCK-216ENST00000458354 SYNJ1O43426 1573 aa50.74■■■■■ 5.71
PNCK-216ENST00000458354 PBRM1Q86U86 1689 aa50.72■■■■■ 5.71
PNCK-216ENST00000458354 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP50.7■■■■■ 5.71
PNCK-216ENST00000458354 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa50.67■■■■■ 5.7
PNCK-216ENST00000458354 ARHGEF11O15085 1522 aa50.66■■■■■ 5.7
PNCK-216ENST00000458354 SYNJ2O15056 1496 aa50.6■■■■■ 5.69
PNCK-216ENST00000458354 CLASP1Q7Z460 1538 aa50.39■■■■■ 5.66
PNCK-216ENST00000458354 CYB5RLQ6IPT4 315 aa50.27■■■■■ 5.64
PNCK-216ENST00000458354 ADAMTS12P58397 1594 aa50.25■■■■■ 5.63
PNCK-216ENST00000458354 ERICH3Q5RHP9 1530 aa50.22■■■■■ 5.63
PNCK-216ENST00000458354 GRIN2AQ12879 1464 aa50.2■■■■■ 5.63
PNCK-216ENST00000458354 ARAP1Q96P48 1450 aa50.18■■■■■ 5.62
PNCK-216ENST00000458354 FHAD1B1AJZ9 1412 aa50.17■■■■■ 5.62
PNCK-216ENST00000458354 NUP160Q12769 1436 aa49.97■■■■■ 5.59
PNCK-216ENST00000458354 CEP170Q5SW79 1584 aa49.95■■■■■ 5.59
PNCK-216ENST00000458354 KIF27Q86VH2 1401 aa49.89■■■■■ 5.58
PNCK-216ENST00000458354 IGF1RP08069 1367 aa49.7■■■■■ 5.55
PNCK-216ENST00000458354 SHROOM2Q13796 1616 aa49.67■■■■■ 5.54
PNCK-216ENST00000458354 CUL7Q14999 1698 aa49.66■■■■■ 5.54
PNCK-216ENST00000458354 ERCC6L2Q5T890 1561 aa49.62■■■■■ 5.53
PNCK-216ENST00000458354 TRHP20396 242 aaPredicted RBP49.54■■■■■ 5.52
PNCK-216ENST00000458354 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa49.52■■■■■ 5.52
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